转基因争议尚存
转基因在国际范围内饱受争议的重要原因之一，是其对生态环境和人体健康是否具有危害性。
截至目前，农业部已经公开的进口用作加工原料的农业转基因生物安全证书共有82个。
若将农业部新批准的转基因安全证书计算在内，孟山都已经获得了24个中国农业部批准的进口转基因安全证书，涵盖从大豆到玉米、油菜、棉花准许进口转基因作物的领域。孟山都研发的转基因种子包括苜蓿、油菜、玉米、棉花、高粱、大豆、小麦、甜菜。但是，孟山都也因为转基因种子一直遭受诟病。
中国农业科学院植物保护研究所研究员、农业转基因生物安全委员会副主任委员彭于发曾公开表示，根据《农业转基因生物安全管理条例》，输出国家或地区已允许作为相应用途并投放市场，是我国申请进口安全证书的前提之一。这三个品种除输出国已批准相同用途外，也分别在美国、加拿大、巴西、阿根廷、日本、韩国等多个国家获得批准。
彭于发说，农业部在其他国家安全评价的基础上，又在国内分别开展环境安全和食用安全验证试验。这三个品种都进行了生存竞争能力及对生物多样性影响的环境安全检测和抗营养成分(影响营养成分吸收的抵抗成分)检测及食用安全检测。根据验证结果，评审通过了安全证书申请。
罗云波也告诉本报：“评价项目非常多，通常来讲，食用安全评价通过之后，你怎么用都行。”关于转基因对环境和人体健康的争议问题，他认为，“那是个伪命题，早有定论，没有问题，而且我国并非转基因用得最多的国家。”
美国南达科他州立大学生物及微生物系教授颜旸曾撰文写道，转基因是人为地让一个基因在其非自然的时间、地点、环境进行非自然的表达。因此可以说，任何一个转基因生物都有可能对其所在的生态环境产生一定的影响。这个影响可能是有害的，但也可能是有益的。
颜旸文章中还称，转基因食品安全不安全，关键要看转的是什么基因。对食品安全起作用的是基因的产物，而不是基因本身。
