新的食品安全监管体制，还继续让农业部门来管源头质量。从体制安排来看，这种既管数量又管质量的体制安排，其实是很难管好的。而未来食品安全的源头问题，会成为食品安全最难管，也会是出现问题最多的地方。
据新华社北京3月10日的消息，根据10日披露的国务院机构改革和职能转变方案，国务院将组建国家食品药品监督管理总局。方案提出，将食品安全办的职责、食品药品监管局的职责、质检总局的生产环节食品安全监督管理职责、工商总局的流通环节食品安全监督管理职责整合，组建国家食品药品监督管理总局。主要职责是，对生产、流通、消费环节的食品安全和药品的安全性、有效性实施统一监督管理等。 方案提出，新组建的国家卫生和计划生育委员会负责食品安全风险评估和食品安全标准制定。农业部负责农产品质量安全监督管理。将商务部的生猪定点屠宰监督管理职责划入农业部。
新的食品安全监管机构包括了三个机构：食药总局、农业部、卫生部，虽然与过去相比减少了工商局、质检局、商务部的食品安全职责，但还留下不少遗憾，因为把最难啃、未来会更危险的源头还是留在了食药总局的外边。其实源头问题未来才是中国食品安全需要监管的重心。
食品安全未来的监管难题会逐步上移到源头，2亿多小农户其实是中国食品安全最难治理的部分。而目前农业部门既管生产，又管质量安全，很难兼顾统一。养殖业的抗生素滥用、瓜果类的植物激素滥用、蔬菜类的农药残留、粮食类的化肥过量施用等，不但使食品的原材料质量出现问题，大量的还安全物质进入土壤及地下水，危害更长远，治理也很难。如何不再放任源头的污染治理，单纯靠农业部门自我清理，是不可能的。因为农业部门的主要任务是要保障国家的农产品供给。而数量生产与质量生产其实是矛盾的，为了获得更多的质量，其产量势必要降低。如果考核指标不改革，还是单纯追求数量的增加，宣传“几连增”，未来食品安全会很难走得通。
比如过去我国出现的几次大的食品安全事故都跟源头密切相关，三聚氰胺事故，奶农与农站加水加三聚氰；双汇瘦肉精，还是养殖户为了多卖钱在饲养环节添加了瘦肉精；肯德鸡事件，还是养殖户为了获得高产，过量使用抗生素与激素，所以未来的食品安全监管难点会上移到源头。而目前设计的食品安全监管总局，独把源头还放在农业部门，实则留下巨大隐患。
目前农业污染触目惊心，成了污染大户。历时两年多， 动员57万人、普查近600万个污染源的第一次全国污染源普查结果显示农业污染是“大户”，成为水环境的主要破坏者。农业污染源是化学需氧量的最大贡献者，排放量占四成以上。农业源是总氮、总磷排放的主要来源，其排放量分别为270.46万吨和28.47万吨，分别占排放总量的57.2％和67.4％。农业源污染中比较突出的是畜禽养殖业污染，其化学需氧量、总氮和总磷分别占农业源的96％、38％和56％。此次的普查结果有点出人意料，因为在传统的观念中污染一直都是与工业密切相关的.农业环境污染的代价也是惨重的，不仅已经对现有的生态环境体系造成了巨大的破坏，同时还将在长期影响我国国民的身体健康，从而影响到我国的人力资本积累。
过密化养殖带来重大安全隐患。过去的传统散养有不少弊端，但目前小农户追求“过密化”饲养更危险，许多养殖场普遍存在饲养密集度过高的现状，畜和禽类像囚犯般生活，成百上千的动物被关在狭小拥挤的围栏内，缺乏消毒清洁，恶劣的生长环境使许多家禽疫病抵抗力越来越差。容易暴发传染性疾病。而笼舍狭小，卫生标准偏低并缺乏消毒清洁措施的现状普遍存在，有的养殖户还搞家禽混养，成倍地增加了动物疫病快速、大面积传播的机会。 农户“过密化”饲养引发禽流感传播的重大安全隐患。小农户面临大的龙头企业没有谈判力，只能靠低廉的价格与数量取胜， 20世纪几次世界性的大流感均起源于中国。随着文明的发展，病毒变异的速度越来越快，作为禽业大国和候鸟的主要集散地，中国的家禽养殖方式潜藏着巨大的风险，禽流感的爆发对中国的养殖方式提出了严峻的挑战。
养殖环节的抗生素滥用。高密度的养殖牲畜容易生病，为了防病治病又使用大量的抗生素，这些抗生素最终又通过食物链团残留到人体内，其残留抗生素随着食物链进入人体后，也会引发细菌的耐药性，对人类的健康造成侵害。比如，近年在欧洲等国家出现的“超级细菌”就是如此，目前医学上对它还很陌生，由此产生了新的医学难题。中国每年生产抗生素原料大约21万吨，其中有9.7万吨抗生素用于畜牧养殖业，占年总产量的46.1%。
非法的添加剂，包括瘦肉精、剧毒农药等屡屡发生，一直难以根除。跟工业化农业有很大的关系。三聚氰胺，瘦肉精，苏丹红，抗生素，硫磺，福尔马林，人造黄油，大米香精，漂白粉，滑石粉，避孕药，安眠药，敌敌畏，这些工业原料、准工业原料、人药、兽药，农药等等五花八门的东西，都曾被发现添加到了我们的食物中。
遗憾的是，近三十年来，我国已成为全球农业新技术的试验场，只要是增产的技术，都会被某些科学教者大胆拿来使用。 还好，百姓对转基因大米、黄金大米的强烈抵抗总算让那些技术教们狂热的试验欲收敛一点。瘦肉精被他们率先从美国拿来大规模推广，各种膨大挤剂、摧熟剂、抗生素等都被他们统统拿来使用，都被披上“科学”的外衣，以为加上“科学”二字，什么都安全了。 如何对滥用科学者进行伦理的限制与教育，进行法律的惩罚，一直是中国科学界面临的难题与空白。
工厂化农业虽然解决了我国的粮食安全问题，但其负作用也令人忧心。如果不再盲目地为了产量牺牲质量，需要从顶层设计，从过去单纯的重视粮食的数量安全，到重视粮食的质量与质量双安全。
农业部门能完成数量与质量的双重重任吗？
