食用菌工厂化生产是食用菌产业发展的方向，是推动食用菌规模化、集约化、标准化生产的重要举措，也是三明市今后一段时期食用菌工作的重点。大力发展食用菌工厂化生产，对提高三明市食用菌产业科技含量和推动食用菌产业转型升级、产品优质生产、实施品牌经营等都具有重要积极作用和重大经济价值及产业发展意义。
目前，三明市食用菌工厂化生产势头较好。据统计，目前全市食用菌工厂化企业有19家，日产鲜菇能力达30吨，年生产规模达3500万袋以上，产值超1.2亿元。尤其是去年全市食用菌工厂化发展最快，新投产、新开工、新扩建的企业共有8家，其中新投产5家，扩建1家，在建2家，总投资达7000多万元，投资规模是前几年的总和。将乐县禾生原生态菌业有限公司扩建后，日产量从2吨增高到6吨，为目前该市在产最大的食用菌工厂化栽培企业。沙县丰茂生物科技有限公司去年在夏茂置地100亩建设真姬菇生产企业，目前一期厂房在抓紧建设中，该项目总投资预算达8000多万元，日可产真姬菇5万袋，鲜品12吨，年产值达1亿元以上，项目建成后为我市最大的一家食用菌工厂化设施栽培企业。
工厂化栽培的食用菌品种有金针菇、杏鲍菇、真姬菇、白木耳、草菇等，栽培规模最大的品种为白色金针菇、其次为真姬菇（海鲜菇）。全市已发展食用菌工厂化设施栽培企业的有将乐、泰宁、建宁、尤溪、沙县等。其中泰宁和将乐县为最多，分别达5家和4家。
食用菌工厂化生产与传统栽培相比，具有五大优势：
一是不与其它农作物争田。以往大部分食用菌都是种在大田里，占用了大量的耕地，出现了食用菌与农作物生产“争田”的矛盾，而工厂化栽培食用菌全部在工业园区、乡村山地以建厂房在室内栽培为主，可大大缓解与农作物生产“争田”的矛盾。
二是可实现周年生产。工厂化栽培通过一些先进的机械设备实行人工控温、控湿、控光，使食用菌生产不再受季节变化等极端自然气候的影响，实现了周年生产，天天都可以吃到新鲜可口的食用菌。
三是产品优质绿色。工厂化栽培从菌丝培养到出菇全程进行设施控制，生产出的菇体整齐、色泽一致，再加上封闭式管理，出菇环境较好，减少了病虫害，实现了产品的优质、安全、绿色。
四是减轻劳动强度。工厂化栽培食用菌多为机械化和智能化、企业化管理，农民可像工厂工人一样8小时上班，不受日晒雨淋的劳作之苦，大大减轻了劳动强度和解决年青人不想当农民的就业问题。
五是市场潜力巨大。目前，工厂化设施栽培的食用菌产品可销往上海、杭州、广东等地的农贸市场，通过积极申请绿标、注册品牌等手段完全可以打入大型超市，卖价高，市场潜力大。
今后，三明市将持续好的发展势头，推动食用菌工厂化生产平衡发展，逐步实由分散零星种植、粗放经营向工厂化设施栽培转变，推进食用菌产业转型升级。
