在发病的早期和中期，一般多采用清热解毒、化湿凉血疗法，常用的药物有银花、连翘、黄芩、栀子、生苡仁、牛蒡子、蝉衣、紫草、芦根、竹叶、生石膏、黄连、灯芯草等。发病后期，若见手足心热、食少、烦躁不安等，可以加入生地、麦冬、白薇、玉竹等养阴清热之品。
患儿在发病前数天，咽喉部位与粪便中就可发现病毒，此时即具有传染力，通常以发病后一周内传染力最强，而患儿的粪便在发病3～5周后仍具有传染力。这也是该病易于传播、流行，预防难度较大的原因。
中医理论认为，本病的病因为外感湿热疫毒。当疫苗湿热之邪伤及肺脾两脏时，造成肺卫失和或毒邪蕴积于脾，使脾主四肢及开窍于口的功能失调，出现上述的临床特征，同时可伴有发热、流涕、微咳等类似夏季感冒的症状或流涎、拒食、烦躁等症。
西医对于手足口病的治疗主要以抗病毒为主，相比较而言，中医治疗本病更具特色且素有成效。针对宝宝比较多见的症状，给妈妈们介绍几个小方子，可以在医师的指导下使用。
1.如果孩子以手足疱疹为主，可用金银花15克、板蓝根15克、蒲公英15克、车前草15克、浮萍15克、黄柏10克，水煎外洗疱疹处。
2.如果孩子以口腔疱疹为主，可用西瓜霜、冰硼散、珠黄散，任选一种，涂擦口腔患处。
3.如果孩子出现口腔溃疡，疼痛明显伴有烦躁、哭闹、大便秘结，可以用银花15克、淡豆豉9克、竹叶10克、清茶少许，煎水代茶饮。也可服用黄栀花口服液，每次5～10毫升，一日2～3次。
4.出现牙龈红肿者，可用板蓝根、黄苓、白藓片、竹叶、薄荷煎水含漱。
5.手足红肿明显，可用黄苓、黄连、丹皮、板蓝根、白藓片、地肤子、忍冬藤、红花煎水清洗患处。
6.如果孩子出现食欲不振，不必强制进食，可以试一下荷叶薏苡粥。取鲜荷叶一个，洗净切碎，取薏苡仁20克、大米适量，加水适量煮粥食用。
附： 预防手足口病中药处方
组方：金银花6g、芦根10g、淡竹叶3g、生甘草3g。
用法：水煎服，一日两次。
适用对象：3岁以上婴幼儿可以减量服用，3到6岁可服用本剂量，6岁以上加服。
功效：清热解毒，生津化湿，适用易感人群。
另外特别指出，手足口病大多以发热起病，在宝宝发热时不可急于退热而给宝宝使用激素。手足口病是肠道病毒感染，使用激素抑制了孩子的免疫力，却不能清除病毒，会导致病情加重，甚者可能会使宝宝出现生命危险，并且在药物预防上，治疗手足口病采用中药效果显著，一般用内服药和口腔涂药相结合，无并发症者一周左右即可治愈，预后良好。可采用抗病毒药物治疗，如利巴韦林及中成药抗病毒口服液等；也可采用清热解毒类的中成药，如清热解毒口服液、双黄连口服液、蒲地兰口服液等或二花、菊花、生甘草泡水喝；亦可加强外治，如西瓜霜、冰硼散、珠黄散等涂搽口腔患处，炉甘石洗剂涂于手足等疱疹患处，康复新液涂搽口腔患处及手足疱疹患处；如发热超过38.5℃，应及时退热，同时可以给患儿口服维生素C、维生素B等；出现合并症者需对症处理及住院治疗。
小编向大家还推荐了另外三种预防措施：用布做个中药香囊，把藿香、艾叶、肉桂烘干磨成细粉装入其内，每天让孩子挂在胸前，睡觉时放在枕边，半个月到一个月换一次香囊内的中药；把中药藿香、艾叶放入敞开的容器里，加入少量水，每天加热熏蒸房间30分钟；艾条1支，每天燃熏房间10分钟至15分钟。
