由于日本大地震引发核辐射污染危机，台湾卫生部门３月１２日起全面加强自日本进口食品及商品的检测；3月22日起，对日本进口的生鲜或冷藏、冷冻的蔬果、水产品、海藻、乳制品、矿泉水及婴儿食品等，逐批查验。目前台湾食品市场供应暂未受明显影响。
综合台湾媒体报道，迄今为止，在台湾已检验过的２００项日本食品中，除了一批生鲜蚕豆外荚量测得微量放射物质外，其余全部合格。
目前台湾菜市场供应量、批发价等并无太大波动，蔬菜行情未受明显影响。台湾菜农呼吁，正值岛内蔬菜生产旺季，市场供过于求，台湾消费者应多吃便宜、品质有保障的台湾蔬菜。
台湾各大饭店食材供应正常，部分以往从日本空运海鲜食材的餐饮业，已转而寻求美国、加拿大食材或澎湖海鲜替代，以确保消费者饮食安全。
有不少民众忧心辐射影响台湾东北部海域鱼类，台湾学者表示，海水随洋流移动被稀释，到达台湾东北海域时，辐射量已慢慢被稀释掉。只要严格把关进口食品，民众不必过于恐慌，但应避免吃鱼类内脏。
针对外传日本福岛周遭海域已遭到辐射污染，台湾渔业部门表示，将利用卫星定位系统加强监控，确保不会有受辐射污染的水产品流入市面。
