粮食补贴的目的是保护农民利益，增加农民收入。但实际经验表明，补贴通过国有粮食收购企业这个中间环节来实现，导致大量的国家补贴在中间环节被截留或流失，农民从国家的补贴和保护中并没有得到应有的好处。据报道，安徽省财政以前每年要拿出40亿元补贴粮食，但只有4亿元能进入农民的口袋。对中间环节进行补贴，还使粮食流通市场遭到扭曲。国有粮食企业储粮越多，得到的补贴就越多，至于收进来的粮食能否销售、能否有盈利并不很重要。因此，在一些粮食主产区，很多粮食企业热衷于扩大库存，以达到坐吃补贴的目的。结果是库存规模长期居高不下，库存粮食大量陈化变质。甚至还有挂空账而不收购，大量骗取国家补贴的现象。
在中间环节补贴粮食而在终端市场环节压低粮价，绝大部分补贴被粮食流通的中间环节“坐吃山空”，最后是造成两个极端的结果：一是农民种粮亏损，积极性不高，影响国内的粮食安全；另一个极端是粮价太低，即使国内市场上有大量粮食，它们也会被选择出口或走私，从而出现“有粮不稳”的反常现象。 从本质上我是赞同国家对农业进行补贴的，但是补贴如何能实实在在的到达农民手中是一个关键问题，如果补贴到不了种田者手中，如果补贴被中间环节层层盘剥，则补贴就失去应该的意义而成为官僚和小集体的赚钱工具。所以对补贴制度进行改革，加强监管，提高补贴效率才是关键。另外适当的提高粮食的市场价格，让农民有更好的收入也是可行的。
