我国保健食品自1996年实行国家审批制以来，初步形成了比较完整的保健食品产业，成为社会主义市场经济发展的重要支柱，也为提高国民健康水平发挥了积极作用。
但由于相关法律法规不够完善、市场监督管理不力以及部分企业不法经营等原因，保健食品产业出现了一些不和谐因素：一是重视注册审评，强调市场准入，疏于市场监督管理；二是同类产品重复审批现象严重，造成国家资源的巨大浪费，也给产品申报者增加了负担；三是多数保健食品很少进行长期慢性毒性试验，存在严重的安全隐患；四是保健食品申报者瞒报生产工艺和配方，并在实际生产过程中任意修改工艺和添加未经批准的原料；五是没有制定用于保健食品的动、植物提取物的质量标准，对原料的生产条件、工艺以及原料供应商的资质等缺乏监管；六是一些保健食品销售公司通过“名人效应”等方式夸大产品效果，网上的虚假广告更是处于失控状态。
保健食品产业的有序发展，与广大群众的饮食安全、身体健康密切相关。为此建议：
一、完善相关法律法规，明确保健食品的注册审批职责，实施分级管理机制。
1.依据《食品安全法》，制定《保健食品监督管理条例》等法律法规，明确保健食品的市场监督管理职责、内容以及标签管理、广告宣传等。把注册审批和市场监督管理置于同等重要的位置，逐步把重视注册审批、严把审批准入关的模式，转变为注重事后监督、注重产品原料审批的管理模式上来。
2.取消营养素补充剂的注册审批制度，政府主管部门可根据全国营养调查结果和居民营养素所需量等，制定营养素原、加工工艺以及产品的营养素含量、服用剂量和检测方法等标准，企业自由申请备案。对投放市场的产品加大监督力度，并制定退出机制。
二、研究制定保健食品的原料标准，从源头抓起控制产品质量。原料生产厂家施行全程可溯源管理，对所用生药材的来源、质量、购货合同、检验报告以及出入库手续、加工工艺等进行全程监督管理，并对终产品(保健食品原料或半成品)的流向予以跟踪管理。
三、制定保健食品监督长效机制，加大保健食品行业的专项整治力度。进一步加强保健食品广告的审批和监督管理，加大对虚假广告的惩处力度。
