备案号编排格式为：（各省、自治区、直辖市行政区划代码前两位）（四位顺序号）S──（年代号）。顺序号由省级卫生行政部门自行编排。
第十三条省级卫生行政部门在办理备案过程中不得以任何名义收取费用。
第十四条省级卫生行政部门应当在发给企业备案凭证之日起20个工作日内向社会公布备案的企业标准，并同时将备案的企业标准文本发送同级农业行政、质量监督、工商行政管理、食品药品监督管理部门。
企业要求不公开涉及商业秘密的企业标准内容的，应当在备案时提出书面意见，并同时提供可向社会公布的企业标准文本。
第十五条有下列情形之一的，企业应当主动对企业标准进行复审：
（一）有关法律、法规、规章和食品安全国家标准、地方标准发生变化时；
（二）企业生产工艺或者食品原料（包括主料、配料和使用的食品添加剂）及配方发生改变时；
（三）其他应当进行复审的情形。
第十六条企业标准备案有效期为三年。有效期届满需要延续备案的，企业应当对备案的企业标准进行复审，并填写企业标准延续备案表，到原备案的卫生行政部门办理延续备案手续。
第十七条企业经复审认为需要修订企业标准的，应当在修订后重新备案。
备案的企业标准有效期届满，但企业未办理延续备案手续的，原备案的卫生行政部门应当通知企业在规定的期限内办理相关手续；企业在规定的期限内仍未办理的，原备案的卫生行政部门应当注销备案。
省级卫生行政部门应当在延续企业标准备案或者注销企业标准备案之日起20个工作日内向社会公布延续或者注销情况。
第十八条省级卫生行政部门接到有关监管部门通报，企业没有按照备案的企业标准组织生产时，应当按照下列情况作出处理：
（一）对属于本办法第二条第（一）项的企业标准，有关监管部门建议注销备案的，予以注销。
（二）对属于本办法第二条第（二）项的企业标准，予以注销。
第十九条省级卫生行政部门发现备案的企业标准弄虚作假的，应当予以注销。
第二十条省级卫生行政部门在注销备案前，应当告知企业有听证的权利。企业要求听证的，卫生行政部门应当按规定组织听证。
第二十一条2009年6月1日前已经在质量监督部门备案的企业标准，在备案有效期内继续有效，不需重新向卫生行政部门备案。
第二十二条省级卫生行政部门可以依据本办法制定实施细则。
第二十三条本办法自发布之日起施行。
