三类学校进行预防性服药
如果学校属于第三类学校的第一种情况，要求卫生部门协助当地所有学校开展晨午检和疫情日报、零报告，并要对重点或高危人群进行预防性服药和免疫接种。
学校方面要停止举办校内各种大型师生集会和会议等活动，并且可采取临时停课或暂时关闭措施。
原则上，停课范围根据疫情波及的范围和趋势由小到大确定。如果14天内，同一班级出现两例及以上甲流病例时，该班级可停课；如果14天内，同一学校有两个及以上班级需要停课时，该班级所在年级可停课；如果14天内，同一学校有两个及以上年级需要停课时，该学校可全体停课。
停课时间不少于7天，自最后一例甲流病例被隔离或离校之日算起。
当学校属于第三类第二种情况时，经当地政府批准同意，对出现病例的中小学、幼儿园等实施全校(园)停课措施；对出现病例的高校实施学生停课不离校，在校进行观察措施。
学校防控甲流方案发布同班级14天内现两患者可停课
幼儿园出现病例至少停课7天
昨天，教育部和卫生部联合印发了《学校甲型H1N1流感防控工作方案(试行)》，按照学校不同的流感疫情分成三种不同类型，并根据不同类型制订了具体的处理办法，如果14天内，同一班级出现两例及以上甲流病例时，该班级可停课；幼儿园等幼托机构一旦出现病例至少停课7天。
复课后要连续14天报健康状况
方案中表示，当发现甲型H1N1流感疫情后，如需要采取停课、放假等疫情防控措施，应由当地卫生行政部门组织专家组，对疫情风险进行评估。并根据结果，会商当地教育行政部门，共同向当地政府、甲型H1N1流感联防联控工作机制或防控指挥部提出停课、放假的建议。经其审核批准后，宣布执行。
停课期间，如有新病例发生，可适当延长停课时间。当停课、放假时间超过7天，由当地卫生行政部门组织专家组评估。达到复课条件的，经当地教育行政部门报请当地政府、甲型H1N1流感联防联控工作机制或防控指挥部批准后执行。
复课前，必须对教室、阅览室、食堂、厕所等场所进行彻底清扫消毒；因甲型H1N1流感暂时停课的学生，必须在恢复健康，经有关卫生部门确定没有传染性并出具有效的复课证明后方可复学。
复课后，未痊愈的学生应继续居家隔离治疗，至其病后7天或症状完全消失后24小时(以两者之间较长者为准)，
