三者的致病源均为病毒，但病毒种类不同。SARS由冠状病毒引发疾病；禽流感是由流感病毒甲型H5N1亚型致病；猪流感的病因目前认为是流感病毒甲型H1N1亚型。流感病毒属于RNA病毒的正黏病毒科，分甲、乙、丙3个型。其中甲型流感病毒多发于禽类，一些亚型也可感染猪、马、海豹和鲸等各种哺乳动物及人类；乙型和丙型流感病毒则分别见于海豹和猪的感染。
美国疾病控制和预防中心2009年4月24日报道，两名南加利福尼亚儿童4月17日感染猪流感，并分离出流感病毒甲型H1N1亚型，虽然该病毒并不是一种新病毒，但是在病毒的基因测序中发现了新的片段，这说明这种病毒很可能发生了变异，如果是这样，人类可能根本没有对猪流感的抵御能力或者抵御力极低。
猪流感、禽流感和SARS致死原因相同，这三种疾病的表现类似，即流行性感冒症状，包括咳嗽、咽痛、流涕、发热等，严重患者均罹患肺炎，最后导致难治性呼吸衰竭而死亡。
猪流感、禽流感和SARS传播途径不同。禽流感目前还未发现可以在人与人之间传播，只是由禽类传染给人；SARS已经证实存在人与人之间的传播；猪流感现在看来极有可能存在两种方式传播，即猪传染给人，人与人之间进一步传播。
猪流感、禽流感和SARS预防手段相同，不与病畜和病禽接触，勤洗手，有流感症状的患者应到医院就诊检查，疾病流行时期减少到公共场所次数，等等。
另外，禽流感和猪流感从发病率和死亡率目前没有统计，还无法比较。但是二者在治疗上，及时使用“达菲”都可以起到比较好的治疗效果。从症状上来看，二者非常相似，区别不大，临床上很难区别出来，必须通过实验室才能分辨。流感分为很多种毒株，如果是人类比较熟悉的毒株，防治上就相对容易一些，发病率死亡率就相对容易控制。
