疫苗手段可防治吗？
既然H1N1三源同配株对人及猪均不利，为什么我们无法消除它们呢？这主要是与病毒的变异迅速有关。在1998年前，猪流感病毒并未对美国的养猪业造成多大的经济损失。但随着三源同配株的出现，经济损失开始剧增。为了降低损失，养猪户们开始采用疫苗来保护他们的猪群。
不过当人类利用疫苗后，病毒也开始了迅速的进化变异过程。病毒通过改变其表面蛋白，来突破免疫防线。从这个角度来说，人类生产疫苗似乎在同病毒进行赛跑。出于安全考虑，世界各国在生产疫苗方面均有严格的规定，疫苗在大规模进入市场前，要经过长达数月乃至数年的实验和检测，这使疫苗变化的速度滞后于病毒的变化速度，也使得人类总是棋差一着，被病毒远远地甩在了后面。
人们对使用疫苗来防疫甲型H1N1流感病毒还有另外一个担心，就是会否因为使用疫苗而导致人类流感的大流行。对于这个问题，人们曾非常担心在禽流感中出现这种情况。有证据表明，墨西哥为防治H5N2流感病毒，曾对鸡进行过疫苗免疫，结果发现引发病毒出现变异，出现了新的病毒株。不过对于甲型H1N1流感病毒进行疫苗免疫防控，科学家认为不应导致流感在人类中大流行。
科学家认为，对于甲型H1N1流感病毒的防治，最理想的是能够开发出一种广谱性的猪流感疫苗。这种疫苗既可以对病毒的内部结构发生免疫反应，同时也可由病毒的表面蛋白激活抗体。目前科学家在考虑对活病毒进行基因改造，试图使其无法进行复制，并可激活能明显区别于流感病毒的抗体，同时还能对可避开免疫系统的猪流感病毒发挥免疫作用。不过这种理想的疫苗说来容易，开发过程则会十分的艰难，不仅耗时耗力，还需要大量的研发经费。
