中草药因毒副作用小，不易产生耐药性，已作为渔药成份广泛使用。渔药中常用的中草药有大黄、黄柏、黄芩、黄连、乌柏、板监根、穿心莲、大蒜、楝树、铁苋菜、水辣蓼、五倍子、菖蒲等。从中草药提取有效杀虫、杀菌活性物质已取得了一定的进展。
渔药使用安全是水产养殖的一个重要问题，已引起社会高度关注
水产品的药物残留问题已经引起了社会的普遍关注，要控制水产品的药物残留，保证水产品的安全，就必须要重视渔药的安全使用与科学管理。近几年先后出现的氯霉素、恩诺沙星、孔雀石绿等涉及到渔药使用安全的事件是长期不科学使用渔药所引起的矛盾的集中暴发。为了控制渔药在水产品中的残留，保障水产品的安全，国家发布了一系列标准、法规和条例，并从2000年起开始对我国水产品中的渔药残留进行抽捡，同时从源头抓起，加强对渔药的生产、销售和使用的管理。
我国渔药使用管理体系逐步完善，渔民规范用药的习惯正在形成
2004年新的《兽药管理条例》正式实施，推动了渔药规范使用和管理的进程。根据该条例，各级渔业行政主管部门在一年多的时间内为规范用药做了大量的工作，如科学用药的宣传、药物残留在水产养殖动物体内的控制等，使我国渔药的使用向规范的道路上迈出了坚实的一步。据“渔用药物代谢动力学及药物残留检测技术研究”课题组统计，由于向山东、河北、湖北、江苏、 浙江、上海、海南等省市10余个渔区(渔场)的渔民宣传、指导水产养殖合理、规范用药，使这些渔区的 养殖产品达到100％无公害，并取得了巨大的经济效益和社会效益。据统计，10余个养殖示范区累计增收3.13亿元，取得间接经济效益41.28亿元。
一、渔药药理学等基础理论滞后，渔药使用存在盲目性
我国对渔药药动学的研究起始于上世纪90年代末，先后对氯霉素、环丙沙星、呋喃唑酮和磺胺二甲嘧啶等渔药在罗非鱼、中华绒螯蟹、南美白对虾及中华鳖等水生动物体内的代谢动力学和残留消除规律进行了研究，并比较研究了给药方式、给药剂量和年龄等因素对药动学的影响，制订了一些渔药的最高残留限量及其相应的休药期。但与社会发展的要求还存在着较大差距，如研究的药物种类少，特别是对药物的代谢产物的研究尚未涉及；研究的水产动物种类有限；对病理模式下的药动学规律尚不清楚；对影响药动学和药效学的因素的研究还很欠缺等。我国在制订残留限量、休药期、给药剂量及用药规范等方面的资料比较缺乏，导致渔药的使用存在着很大的盲目性。
二、有效安全的渔药及其剂型匮乏，制剂的工艺水平低
渔药企业是我国渔药开发的主体，由于企业急功近利，忽视基础研究，导致我国渔药的科技含量低，某些渔药虽然价格低、效果明显，但对人体和环境危害较大。目前我国大部分渔药来源于农药、人药或兽药，至今尚未形成水产养殖专用的渔药系列。此外，对禁用渔药替代品的研究未能及时跟上，以致禁用渔药屡禁不止。剂型与制剂的多样性与其用途的专一性，是药物发展的重要标志之一。渔药的剂型和给予方式不同，机体吸收渔药的速率和数量不同，药效也发生差异，不少氧化剂由于没有合适剂型，极易失效，甚至发生意外爆炸。
