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中沙科技界联姻研究 椰枣基因组

时间:2009/3/19 17:23:06 来源:科学时报

 “椰枣树是天堂里的植物,阿拉伯人的母亲。”“6个椰枣管一天。”摆放在超市水果摊上的椰枣,在中国人生活中是可有可无的水果。但对于生活在沙漠中的阿拉伯民族来说,易于保存、营养丰富的椰枣却是他们赖以生存的重要食物和经济作物之一。浑身是宝的椰枣树更是承载着高大、正直、坚定、慷慨无私等文化内涵。

  沙特阿拉伯王国的椰枣产量占全世界产量的15%。就像中国人离不开稻米一样,椰枣也是沙特王国重要的生命线。

  如何让沐浴着古老文明的椰枣林焕发更美好的青春?沙特王国阿卜杜拉阿齐兹国王科技城(沙特王国的国家科研管理机构和国家科学研究机构,简称KACST)任命椰枣遗传学家、King Faisal大学农业与食品学院教授Ibrahim  S.Al-Mssallem为首席科学家,投入2000多万美元,启动椰枣基因组计划(DPGP)。沙特王国希望通过完成椰枣基因组计划,建立一个较有影响的生命科学与生物技术中心,拉动生物技术产业发展。

  2007年7月,IbrahimS.Al-Mssallem来到中科院北京基因组研究所考察,随后又访问了其他几个国家的基因组研究中心,最后选择与北京基因组研究所进行合作。双方多次沟通后,制定了数百页的详细项目计划书。

  2008年2月27日,中科院国际合作局收到一份传真,沙特阿拉伯王国KACST副总裁Turki bin Saud bin Mohammed  AI-Saud询问中科院院长路甬祥,能否与中科院合作开展椰枣基因组研究计划。一个月后,国际合作局答复沙特:中科院将支持这一合作项目,合作中涉及的我方内容由北京基因组研究所副所长于军负责。同时,北京基因组研究所也在紧锣密鼓地准备仪器设备配置具体计划、人员招聘、培训等一些前期工作。

  2008年8月,北京基因组研究所11名科研人员赴沙特利雅得市正式启动合作项目。11月23日,于军和IbrahimS.Al-Mssallem签署了合作研究备忘录,正式启动这一国际合作研究项目——由KACST投入经费,北京基因组研究所负责科学规划、主要技术支撑和人员培训等。按照国际惯例,项目结束后,所有的数据和信息将向世界免费公布,成果由参与者共享。

  “椰枣的基因组学研究主要基于沙特丰富的遗传资源和育种经验,椰枣共有450个品系,沙特就有200余种。椰枣基因组的研究为椰枣分子育种、抗虫抗逆研究、提高产量与品质研究等提供重要的生物学数据和理论指导,对于椰枣的资源开发和保护将起到非常重要的作用。”椰枣基因组计划首席顾问于军介绍说,项目主要开展椰枣的基因组学研究,构建椰枣的基因组序列图;开展椰枣的转录组学研究,对椰枣不同组织、不同生长时期的基因表达和转录调控进行全方位的研究;开展椰枣的遗传学研究,对椰枣多个不同的品系进行遗传背景的研究和遗传标记的筛选,为椰枣的遗传育种提供重要的分子标记;同时开展椰枣病虫害方面的基因组学研究,比如红色椰象甲基因组相关研究。

  “红色椰象甲是一种灭绝性的危害椰枣和椰子的外侵害虫,它躲在椰枣树里,很快就能掏空椰枣树。人们用了很多传统和非生物学的方法都不管用。而且它生命力很强,从印度到欧洲和亚洲其他很多地方都能生存。因为没有天敌,繁殖能力、杀伤力又很强,它已经成为沙特危害最大的外侵物种。通过研究其基因组,有望找到生物防控的方法。”于军说。

  于军介绍,椰枣基因组计划进展顺利,已初步建立了基因组和生物信息学实验平台;构建了椰枣Fosmid基因文库;成功完成预试验,包括基因组DNA提取,线粒体、叶绿体基因组分析,转录组分析,椰枣品种遗传背景分析;即将启动高通量基因组、转录组测序工作。

  椰枣基因组计划将在2011年8月结束,但双方合作仍将继续。

  “今年1月,KACST副总裁Dr.Turki bin Saud bin Mohammed  AI-Saud在约见我时口头提议,由KACST和中国科学院共建中沙基因组科学与信息联合研究中心,建立两国间长期合作研究的平台,促进两国青年科学家交流,促进转化研究以及应用研究以造福社会。”据于军介绍,该中心研究领域将涉及通用基因组学与生物信息学研究、人类遗传学与疾病研究、农业基因组学与生物技术研究、微生物基因组学研究与应用等。(易蓉蓉)

 


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