近几年来，我国粮食加工业呈现较快发展态势，对拉长粮食产业链，推进农业产业化经营，带动农业结构优化升级，提高粮食产业综合效益，促进农业增产和农民增收起到了积极的作用。呈现出一些新特点：
（1）以玉米为原料的粮食深加工业发展迅速。玉米是我国三大主要粮食作物中工业用途最广、产业链最长的品种，随着石油价格的大幅度上涨，玉米深加工产品的经济性凸显，成为粮食加工业中发展最快的行业之一。（2）大豆油脂加工能力继续较快扩张，行业兼并重组步伐加快。有关数据表明，2006年，新建大豆油脂加工项目累计形成1100万吨的加工能力（其中60％以上为外资项目），使我国大豆油脂加工业产能达到8400万吨，比2005年增长13.5%。同时，大豆油脂加工业重组整合速度加快，特别是外资并购国内企业数量创历史新高。（3）出现一批粮食 加工龙头企业，粮食产业化经营深入推进。粮食加工业的竞争日益激烈，通过兼并、重组等方式，形成了一批贸工商一体化、具有较强竞争力的大型粮食加工龙头企业，粮食加工业的规模化、集约化取得了积极进展，粮食产业化经营深入推进。（4）粮食加工业布局向主产区转移的趋势明显。近年来，国家不断加大对粮食加工技术研发和装备制造的支持力度，稻米、小麦、玉米、大豆等加工设备与重大关键技术与开发取得了积极成效，为粮食工业发展提供了强有力的科技支撑。
我国粮食加工业虽然取得了长足发展，但与发达国家相比，与现代农业要求相比，仍然存在较大差距，存在的主要问题是：粮食加工能力严重过剩；生产经营方式仍然比较粗放；粮食加工产业化经营模式有待进一步完善；自主创新能力较弱；大豆加工业外资比重和原料进口依存度偏高。
今后一个时期，我国粮食供求将处于紧平衡的态势，全面建设小康社会对粮食加工业发展提出了的新的更高要求，也给粮食加工业发展带来重大挑战：耕地、水资源短缺使粮食加工业发展面临原料瓶颈问题；粮食价格上涨挤压粮食加工业的利润空间；粮食进口潜在风险加大；资源和环保要求提高，可持续发展面临考验。
我国城乡居民生活水平正在从温饱型向小康型迈进，顺应市场消费需求的变化，将使我国粮食加工业呈现如下发展趋势：资源利用的合理化；生产方式的集约化、规模化；经营模式的专业化、产业化；产品质量的标准化。
针对这些问题和挑战，必须采取有效的应对措施：一是严格粮食加工项目的管理和审查，加强对粮食加工业的宏观调控；二是加强科学规划，进行政策指导；三是构建合理的粮食加工体系，保持粮食食品加工业、饲料加工业、转化加工业的协调发展；四是积极培育大型粮食加工龙头企业，推动产业结构升级；五是鼓励粮食产、加、销等产业链环节的整合，推进粮食产业化经营；六是加大对国内粮食加工企业的支持，提高企业的竞争力；七是鼓励和组织内资企业“走出去”，开拓国际资源。
