近年来，蓬莱市在发展现代农业进程中，将农产品质量安全问题放在首位，围绕果品、畜牧、水产三大特色农业，组织建设国家级农业标准化示范区，通过食品安全专项整治，建立健全了一整套产品质量追溯体系，建立起从农田到餐桌的标准化生产体系，为农产品打入国际市场奠定了基础。
扎实抓好农产品加工原料基地建设。制定、推广了《无公害酿酒葡萄栽培技术规程》、《苹果栽培技术规程》等10多个地方标准，修订农产品加工标准22项，深入农村和企业免费发放农产品生产标准汇编手册2万余册。建成国家无规定动物疫病示范区、12万亩国家葡萄标准化种植示范区、16万亩省级苹果标准化种植示范区、国家第二批无公害果品示范基地县等6个农业标准化建设示范区。全市建成无公害农产品生产基地30万亩，绿色食品基地15万亩，先后有5家企业34个产品获得绿色食品标志使用权，9家企业23个产品获得无公害农产品认证，88家企业获得食品质量安全市场准入资格，15家企业获得地理标志产品保护，拉动10万农户通过订单的形式参与农业商品化生产，年增加农民纯收入6亿元以上。
扎实抓好标准化配套工程建设。重点建设五大配套工程，即以减少农药、化肥不合理使用量、确保药残肥残不超标、保护生态环境的“一减双保工程”；以防止农药污染和提高果品质量效益为目的的“果品套袋工程”；以提高土壤有机质含量、提高农产品内在品质为目的的“沃土工程”；以减少农药用量、提高农产品质量安全为目的的田间“灯光工程”；以采用防虫网和遮阳网、实施物理防护措施为手段的“网护工程”。目前，全市小麦全部实现秸秆还田，玉米秸秆还田面积达50%以上；果园自然生草面积2万亩，高标准生草栽培面积5万亩。通过综合利用无公害节本增效技术，年减少农用化肥用量1.7万吨、农药500吨，农产品农药残留合格率达到90%以上。
