解决这些导致坏包现象的问题，可从以下几方面入手：
1、对发酵剂生产设备进行清洗消毒，杜绝卫生死角，在制备工作发酵剂的过程中，采用无菌工具在无菌室内操作，对使用的设备进行有效的清洗和消毒，进入发酵剂生产室的空气必须经过过滤，确保环境、工具、人员的卫生。
2、严格控制奶源的微生物指标是生产合格产品之本，原料乳必须经冷却后储存，储存温度控制在不超过6℃，储存时间不超过24 小时。在生产过程中杀菌温度控制在90℃~95℃，时间为15~20s，原料中的细菌被杀死，达到要求的组织结构及风味。
3、加强生产过程的卫生要求和现场卫生管理，改善生产环境及提高员工的素质，保持良好的个人卫生习惯，将直接有利于提高产品质量。确保生产环境的空气细菌数≤300m-3，酵母菌、霉菌≤5.0m-3。
设备卫生方面：管道的安装要合理，进行有效的CIP 清洗，控制清洗液浓度、温度、流量和循环时间确保清洗的有效性，手工清洗设备做到不留死角，灌装机在维修更换零件后进行清洗消毒，确保设备的清洁卫生。
4、包材质量不合格、起不到应有的避光和防止湿空气透过的作用，复合膜表面有不同程度的微细孔、沙眼、包材薄厚不均，造成切口不正，受热不均，封口不严，出现渗漏，以及包材不卫生，清洁消毒不彻底，都可能造成坏包现象，因而包装膜的卫生质量很重要，包材进入灌装间必须清洁紫外消毒之后使用。包装材料在进厂之前也要按要求严格把关，确保材质质量。
5、运输中磨损、挤压以及贮存运输不在冷链条件下操作，都会造成坏包现象，为确保产品质量、贮存运输须形成冷藏链。
