板蓝根的确有良好的抗菌、抗病毒、抗钩端螺旋体及解毒作用。但是，看起来同样的感冒病症，有的是风热感冒，有的是风寒感冒，临床用药完全不同。即使同样患风寒感冒，不同患者也存在夹湿、内热等个体差异，用药需要区别对待，而板蓝根药性寒凉，属于清热解毒药，对于风寒感冒及风热夹湿感冒的人不太适应，而且久服容易伤脾胃。
我国卫生部曾经公布87种药品属于可以“药食两用”的范围，这些药品、食品理论上吃喝多少都安全无害，其中并不包括板蓝根。也就是说，板蓝根不宜当作食品、饮料摄入，否则会带来危害。例如，在人体内形成耐药性，长期食用者以后一旦得了肝炎、流感等疾病，非但不具有机体免疫能力，反而在使用板蓝根时失去药效。可见，“板蓝根饮料”不能作为日常饮料，不喝或少喝为妙。
