几乎就在美国“9·11”恐怖事件吸引了全世界目光的同时，日本发现疯牛病的消息像一颗重镑炸弹一样给日本民众带来了极度的恐慌。一个多月来日本人谈牛色变，对牛肉敬而远之，使做牛肉生意的人们吃尽了苦头。日本政府千方百计，不惜血本，但是疯牛病风波仍然没有平息。
9月10日，日本政府得到报告，千叶县一家农户的肉牛发现神经性症状，检查怀疑有疯牛病嫌疑。日本政府将样本紧急送往有检查经验的英国复查，结果确认了这就是亚洲的第一例疯牛病病例。消息传出，震惊全日本。一波未平一波又起。10月11日，东京批发市场又一次出现疯牛病牛肉嫌疑。后虽经多次检查排除了这一嫌疑，但日本的牛肉市场彻底崩溃了。政府决定对所有上市牛肉进行逐头检疫，在设备配套之前停止一切市场批发。10月18日，日本全国117处生牛屠宰场设立的检疫所开始全面运营，政府规定检疫合格的牛肉经盖章烙印之后方可流入市场。而检疫中发现问题者，经专家检查确认后再公告社会，期间可疑牛肉一律封存。同一天日本厚生劳动大臣发表了“安全宣言”，他说，日本是世界上食品检疫最严格的国家，保证危险牛肉不会流向社会，希望国民放心吃肉，大胆卖肉。但检疫第一天，东京、神户、北海道等地都发现了可疑病例，虽经两次检查排除了危险性，但这种闹剧还是让国民难于放心。
在接下来的日子里，日本各界纷纷表示在国内出售的牛肉以及牛肉制品绝对没有问题，但是消费者心中的疑虑和不安却始终挥之不去。大量忧心忡忡的消费者开始转而选择猪肉和鸡肉食品，致使日本市场牛肉产品消费量及价格全部直线下坠。农户出栏价格跌到日常价格的一半，零售价格也跌到了平日价格的60%。一些叫苦不迭的农民干脆停止生牛出栏。日本的烤肉店、麦当劳等餐厅被迫降价销售。即便如此，还是有些餐馆因为难以维持生计，被迫关张。
《朝日新闻》刊登的一项民意调查结果显示,四分之一日本人已停止吃牛肉,百分之八十二日本人认为政府处理疯牛症危机的手法有问题。 20日，共同社就有关疯牛病问题对全国100名主妇作了调查。74名主妇表示：“疯牛病风波以后，就控制了自己对牛肉的食用。”其中63人表示，
尽管国家发表了安全宣言，但是仍然“没有吃牛肉的意思”。日本许多地方的公立中小学校、保育所、残疾儿童学校等纷纷停止向学生提供牛肉餐。韩国和中国台湾也相继发表声明，禁止从日本进口牛、羊肉以及与之相关的产品。
为了挽回国民的信任，日本政府费尽心机。首先宣布停止肉骨粉饲料的流通，将由政府收购后统一销毁，其次将感染疯牛病的该千叶农户家的牛全部收购处理，并将对货源地北海道某牧场的子牛进行追踪调查。政治家们开始带头吃牛肉，上百名国会议员举行了“牛排午餐会”。特别是农林水产大臣和厚生劳动大臣，每到一处视察都要对着电视机镜头大吃牛肉，简直成了牛肉推销商。
尽管如此，从发现第一例疯牛病以来，日本政府还是一直处于国内外舆论的强烈抨击声中。
日本政府被指责在最早发现疯牛病时秘而不宣，以及在避免疫情蔓延方面行动缓慢，最终使自己和周边国家陷入被动局面。
迄今为止，日本政府为对付疯牛病已经耗费巨资。东京都等地方政府也向农户提供了低息贷款。牛肉流通市场虽然恢复整体运行，但市场销量一直不佳。而且，在冷库中封存的1.3万吨未检疫牛肉也成了政府的负担。
更糟的是，就在前几天，东京又传出一头母牛接受疯牛病检测，初步化验结果为阳性的消息。目前这头牛正在接受第二次检测，以证实这个化验结果。看来，近期的日本牛肉市场离真正的“牛市”还相去甚远。
