绿色食品水稻、小麦等农作物生产用灌溉水主要包括地面水（河流、湖泊、水库、池塘等）、地下水和天然降水。灌溉用水除要求地面水、地下水、天然降水充沛供给之外，更重要的是对水质的要求。只有经过监测，符合《绿色食品产地环境质量》对农田灌溉水中各项污染物的指标要求的，才可作为灌溉水用于绿色食品水稻、小麦等农作物生产。
《绿色食品产地环境质量》规定了灌溉水的pH值、总汞、总镉、总砷、总铅、六价铬、氟化物、化学需氧量、石油类、粪大肠杆菌等污染物的指标要求。
灌溉水受污染后，污染物通过灌溉在土壤中积累，然后通过根系吸收入农作物体内，可对农作物产生直接影响，使作物减产，品质降低。其中的有害重金属能与作物原生质中的蛋白质结合，导致细胞死亡，即使在少量的情况下，也能置换植物蛋白中的铁、锰等元素，使酶的活性受到抑制、阻碍呼吸等一系列代谢过程。因此绿色食品水稻、小麦生产基地要选择在地表水、地下水水质清洁无污染的地区，要远离对水造成污染的工厂矿山，最好位于地表水、地下水上游。对于某些因地质形成原因而致使水中有害物质如氟超标的地区，也要避开。
什么样的土壤
建构我们的基体
土壤受到重金属、农药残留等污染物的污染后，就会影响植物的生长，影响农作物的产量和质量，通过土壤-植物-动物-人体食物链，最终危害人类的身体健康。
对土地 高标准严要求
一、选择位于土壤元素背景值正常区域的产地，产地及产地周围不应有金属或非金属矿山。如果土壤中某些元素如重金属元素自然本底过高，便会转移、累积于植物体内，并通过食物链危害人类；
二、选择生态环境较好，未受到工、农业污染、生活、交通等污染的产地。工业污染主要是指工业“三废”对土壤的污染。农业污染主要是指化肥、农药等化学投入品对土壤的污染。生活污染主要指生活废水和垃圾污染。交通污染主要为汽车排放物的污染；
三、考虑土壤肥力指标，应选择土壤有机质含量较高的地区。
四、应按照《绿色食品产地环境质量》中对土壤环境质量的要求，进行科学的监测评价。在标准中区分旱田和水田，并且按照不同的pH值规定了对镉、汞、砷、铅、铬、铜等6种污染物的指标要求。只有通过环境监测评价，各项指标都达到要求了，才可以做绿色食品的产地！
