针对畜禽养殖污染问题整改，江西省注重源头治理，强化畜禽养殖“三区”划定，截至目前，全省111个畜禽养殖县(市、区、开发区)全面完成畜禽养殖“三区”划定和地理标注工作，全省共划定禁养区1.45万个，面积约5.12万平方公里。
全省严格落实“三区”规划，大力推进禁养区拆迁、关停、转产等工作，累计拆迁养殖场(户)2.8万多家，减少生猪饲养量近300万头。截至10月底，2017年禁养区内拆迁、关停或转产的畜禽规模养殖场达3253家。中央环保督察反馈我省2634家未配套建设粪污处理利用设施的猪场，累计完成整改的猪场数达2606家，占要求整改数的98.9%，其中赣州、景德镇、上饶、宜春和鹰潭已全部完成整改工作。
依托畜禽养殖标准化建设项目和标准化示范创建等活动，实施节水改造、粪污贮存、固液分离、厌氧发酵、深度处理等粪污处理改造，大力加强规模养殖场粪污处理利用设施建设。据统计，全省10060家规模养猪场，有8583家已配套建设粪污处理设施，设施配套率达85.3%。
为了推进畜禽养殖污染整治，江西省还开展督查情况通报、推行约谈机制，传导压力。省农业厅和省环保厅联合下发了《关于畜禽养殖污染防治工作专项督查情况的通报》，对中央环保督察组反馈问题整改进度滞缓的17个县(市、区)进行了通报。省畜牧兽医局就中央环保督察反馈问题整改进展滞缓问题，约谈南昌市农业局局长和南昌市畜牧兽医局长。省农业厅还以书面形式，向南昌市政府下达了《关于中央环保涉及畜禽养殖污染反馈问题整改督办函》，有效推进了整改。
