在亚洲和美国广泛种植的转基因作物，使欧盟产生了分歧，英国支持种植，法国和德国则表示反对。德国计划在全国范围内禁止转基因作物的种植。
据路透社8月24日报道，德国农业部正在就这一问题，征求各州政府的意见。德国联邦食品和农业部部长克里斯蒂安·施密特要求各州政府在9月11日前对这一问题表明态度。
2015年3月，欧盟理事会通过一项法规，允许各欧盟成员国根据各自的情况，禁止或限制在本国国境内种植某一转基因作物。
也就是说，即使一种转基因作物在欧盟“层面上”被认定是安全的、被批准种植，但各欧盟成员国仍可以有自己的选择，这被称为“选择退出”权（opt-out right）。
根据这一法规，各欧盟成员国需要在10月3日前向欧盟委员会表明自己的态度。路透社称，施密特在发给各州政府的邮件中透露了这一信息。
目前，欧盟获准种植的转基因作物仅有一种，系美国孟山都公司研发的MON810转基因玉米。这种玉米基因组中含有外源基因，能够产生名为Bt的蛋白，Bt蛋白能杀死农业害虫玉米螟，从而减少农药的使用。
据欧盟统计，该转基因玉米在西班牙和葡萄牙有大面积种植。
但2014年3月15日，法国农业部公布一项决议称，鉴于有出版物提出新的科学依据表明MON810转基因玉米会对环境产生危害，且欧盟委员会并未针对法国提交的申请停止批准种植MON810转基因玉米的意见书采取必要措施，随着播种期临近，法国农业部决定禁止在法国境内销售、使用和种植该转基因玉米种子。
据新华网报道， 除法国外，奥地利、保加利亚、波兰、德国、卢森堡、希腊、匈牙利和意大利也曾禁止种植MON810转基因玉米。
此外，2014年10月，20多位欧洲顶尖植物学家联署了一份联名信称，在大多数欧洲国家，转基因作物被禁止进行田间试验，这不是科学原因，而是政治原因。如果仍不允许发展转基因作物，欧洲农业的发展目标将遥遥无期。
但前述法规仅涉及转基因作物种植，而不涉及转基因产品的自由流通和进口，也不涉及转基因研究。
欧盟境内目前有超过58种转基因作物用于生产食品或饲料，主要源自进口。
2015年5月，欧盟委员会批准17种新的转基因产品在欧盟上市，这些产品包括新的玉米、大豆、油菜、棉花等，以及两种鲜花。这是自2013年11月以来，欧盟首次放行转基因产品。
