伴随着经济的高速发展，中国农业政策也开始转型。2005年中国政府取消农业税，开始实施反哺农业的政策，对农业进行补贴。经过十多年的政策实践，中国农业补贴种类名目繁多。以农业部公布的“2013年国家支持粮食增产农民增收的政策措施”为例，包括了农民直接补贴、农机补贴、农资补贴等38项补助，涉及国家支持农业的方方面面。每年补贴农业总额超过2000亿元。
更重要的是，为了保障粮食安全，中国实施保护价敞开收购。在2000年后，为了保证农民产粮的积极性，最低保护价不断提高。到现在使得中国国内粮食价格远远高于国际市场，而且玉米等粮食的库存不断创出新高。
以2015年5月的粮食价格为例，中国国内小麦和玉米的价格均超过国际市场价格2倍以上。中国农业在国际上已经没有竞争力，如果开放进口，中国农业会被国际市场彻底打垮。原因主要有三：第一，国内生产成本的增加，主要是劳动力成本的增加非常迅速。第二，人民币汇率的升值。第三，中国玉米等粮食库存的暴增，使得国际市场认为中国短期内会减少进口，并担心中国会倾销过剩粮食，所以国际市场粮食价格萎靡不振。
其实，中国现在农业补贴遇到的问题欧美日都遇到过。上世纪70年代，国际粮食价格高企，为增加农民收入，促进农民收入独立，欧共体与日本相继采取并强化了农业价格支持政策，使得国内价格与国际价格脱钩。随着国际粮食价格在80年代后下降，由于政治压力，支持价格难以下行，并不断加码，最终国内价格开始不断高于国际市场，使得发达国家的农业竞争力丧失。同时农业补贴所需财政负担日重，占用了大量的政府预算。欧盟农业补贴占欧盟预算在2000年左右一度超过60%。价格支持导致大量粮食生产过剩，欧盟境内粮食储备暴增。以日本为例，由于存在大量的农业兼业活动，农民的农业收入尤其是稻米种植收入占家庭收入的比重下降到了1/3以下，农业价格补贴对农民收入的帮助有限，但是如果去除补贴，毕竟对农民收入有损，阻力仍然很大。
面对国内价格不断背离国际市场价格，农业竞争力不断下降的现实，中国有必要吸取欧洲和日本的教训。中国的农业补贴政策必须改革，防止农业补贴的陷阱在中国重演。
要改革，必须回到一个基本的问题：为什么要补贴农业？农业有很多功能：包括保障粮食安全功能，农民收入来源功能，环境生态功能，文化传递功能等。对于现阶段来说，最重要的就是保障粮食安全功能和农民收入来源功能。对于欧洲等国来说，增加农民收入是农业补贴的主要目标。从政策制定的角度来说，提高保护价收购能够同时满足这两个功能：既能促进粮食生产、保障粮食安全，又能增加农民收入，一石二鸟。这也是粮食保护价收购在日本、欧洲以及现在的中国流行的原因。很显然，日本和欧洲的历史以及中国的现实表明，以不断提高的保护价敞开收购会导致农业竞争力下降。更重要的是，随着国际市场粮食价格的下降，补贴的财政负担会日增，从而压迫整个政府的财政系统。
中国政府也意识到了问题，对部分农产品转化支持方式，开始实施目标价格补贴，从而减少对价格的扭曲。但是目标价格补贴存在两个问题：一，目标价格补贴后，政府不再敞开收购，补贴的钱花出去了，手中却没有掌握存粮，不能满足保障粮食安全的目标。二，在实际操作中，如何界定差价和补贴金额？由于土地质量差异，产出不同，如何核算补贴就成了一个大问题。从新疆棉花实施目标价格补贴的实际情况来看，存在不少骗补行为。
中国农业补贴改革必须对补贴的方式按照目标分类。哪些补贴属于保障粮食安全，哪些支持属于增加农民收入，必须明确。比如为了保障粮食安全，也可以实施保护价收购，国家维持一定量的储备，但是收购的量要有限额，不能敞开收购。而对于支持农民收入，不如学习欧洲，按照承包地面积或者农业人口数直接发放补贴，减少市场扭曲与交易成本，让农民直接得到好处。
