在分组审议食品安全法修订草案时，一些常委委员和列席人员建议，进一步完善食品安全事故调查程序。
草案规定：调查食品安全事故，应当坚持实事求是、尊重科学的原则，及时、准确查清事故性质和原因，认定事故责任，提出整改措施。调查食品安全事故，除了查明事故单位的责任，还应当查明负有监督管理和认证职责的监督管理部门、认证机构的工作人员失职、渎职情况。
全国人大华侨委员会委员李昭玲建议在上述规定中，进一步明确查处食品安全案件的指导性原则，比如：按照什么原则收集证据，怎样调查事故原因，如何判定事故责任等。
李昭玲说，在食品安全事故调查中，事故因果关系的认定是查清事故原因、确定事故责任的关键。但实践中存在一种情况：在发生“扁豆中毒”的情况下，难以依据现有的食品安全标准来查明事故原因，也就难以确定食品安全事故责任。因此，建议在现有规定的基础上，进一步明确办案指导原则指引事故调查活动，以弥补在适用标准时技术手段的不足。
王毅委员说，草案关于食品安全事故调查一章没有突出事故处理的关键环节，建议修改时突出三个方面：明确工作原则和程序；明确组织责任和分工；建立协调机制。
董中原委员说，草案规定，有关单位和个人应当配合食品安全事故调查处理工作，按照要求提供相关资料和样品，不得拒绝。任何单位和个人不得阻挠、干扰食品安全事故的调查处理。但对于拒绝、阻挠和干涉的法律后果没有规定。为了加强法律的威慑力与执行力，建议在法律责任一章中增加拒绝提供相关资料和样品、阻挠和干涉食品安全调查的法律后果的条款。
