2014年9月3日，台湾地区“卫生福利部”发布部授食字第1031302284号令，制定“基因改造食品咨议会设置办法”全文十条，如下：
第一条 本办法依食品安全卫生管理法（以下简称本法）第四条第四项规定订定。
第二条 基因改造食品咨议会（以下简称本会）的任务，为就下列基因改造食品管理与监督相关事项的咨询或建议：
一、基因改造食品政策及策略的订定。
二、基因改造食品计划的研定。
三、其它有关基因改造食品事项。
第三条 本会置委员十三人至十七人，由“卫生福利部”（以下简称本部）部长就食品卫生、营养、分子生物、医学、毒理、农业、法律等学者专家聘兼之。
前项委员，其中任一性别不得少于委员总数三分之一。
本部部长就第一项委员中聘请一人为召集人，另一人为副召集人。
委员任期三年，期满可续聘。委员因故无法完成任期者，可另遴聘兼之，其继任者任期至原委员任期届满之日止。
第四条 本会置执行秘书一人，工作人员若干人，办理本会业务，由本部部长就“卫生福利部食品药物管理署”（以下简称食药署）相关业务人员派兼之。
第五条 本会会议以每年召开二次为原则，必要时可召开临时会议，应有全体委员过半数出席，始得开会。
第六条 本会会议由召集人担任主席；召集人不克出席时，由副召集人代理的；召集人及副召集人均未能出席时，由召集人指定委员一人为主席；不克指定时，由出席委员互相推举。
第七条 本会委员的回避事项，依行政程序法的规定。
第八条 本会开会时，可视需要，邀请相关专家学者、机关代表及食药署相关单位人员列席。
第九条 本会委员及列席人员对会议资料、委员意见或会议结论应予保密，不得泄漏。
前项会议结论经依行政程序核定后，可由“食药署”公开。
第十条 本办法自发布日施行。
