据台湾《联合报》报道，"看到小猪一只只死掉，真的很心疼！"仔猪腹泻疫情蔓延已5个多月，台湾猪农日前抱怨"农委会"应变消极，还淡化疫情。
最紧要的是疫情未见控制，猪农怨声连连，学者也认为目前的"局面"难以预防。台湾大学兽医学院名誉教授赖秀穗直指疫情严重。
而在这波仔猪疫情中，屏东县最严重，本身也养猪的台湾养猪协会常务监事潘连周说，全屏东县有9成养猪场受害，死亡仔猪超过30万头，"农委会动植物防疫检疫局"说只有14万，"根本（是）黑白讲".
仔猪腹泻疫情从南部传出，台南、云林也跟着"沦陷"，半个月前彰化县1千头仔猪死亡，昨天已增加到2万多头，感染的养猪场也从1月的48所，增加到91所。云林感染仔猪也有3万多头。
疫情持续扩散，彰化洪姓饲料商说："不少养猪户没通报，（当地）实际感染（养猪场数目）应超过8成".
财团法人动物科技研究所研究员陈启铭表示，这波疫情来源于病毒株变异，威胁是以前病毒的10到50倍，这是前所未有的严峻疫情。
彰化县养猪协会理事长张胜明认为，"农委会"虽然说是美国同型病毒株，但怎会流入台湾？如何防堵？这才是更重要的问题。
不过，疫情到底从哪开始，至今仍然是谜。屏东、彰化等县市都把矛头指向云林，云林反驳，认为去年7月屏东送的检体就发现腹泻病毒，云林则在11月传出疫情。对于云林县的说法，屏东县家畜疫病防治所长徐荣彬表示"不清楚".
云林县动植物防疫所长黄鸿猷表示，腹泻感染途径目前不明，屏东的仔猪贩售到各地，可能是传染途径，饲料厂的货运车足迹遍及全省，也可能传播病毒。
