相对于空气污染、水体污染，土壤污染的治理难度更高，其中，农业用地比工业用地更难治理。近日，在市政协人资环建委专题调研“本市土壤保护和修复情况”中，市农科院坦称，目前本市共有280万亩农业用地，其中水稻种植面积160万亩，蔬菜种植面积50余万亩。近年来，本市土壤污染呈上升趋势，农药、有机化肥的大量使用，已成为土壤重金属污染的重要原因。 专业人士表示，相对工业用地，农业用地更难修复。前者有不少是废弃用地，既不用于居住，亦不用于生产，有足够的时间来治理。后者虽然可以通过改种植物，将土壤中的重金属分离出来，然而，这些土地承担着生产粮食蔬菜的重任，很难腾出时间“休养生息”。
“上海人多地少，为保证食品供应，我们只能尽量提高土地复种指数，增加作物产量。现在上海的粮食产量要求20亿斤/年，绿叶菜产量要求4000吨/天，有这些指标压着，我们的土地一年四季都不能休息，哪有时间来修地？”市政协常委、市农科院院长吴爱忠说。
同时，相关人士提出，如果上海换地修复，农民的经济补偿将是个问题。此外，万一土地被挪作他用，只会起到适得其反的效果。因此，耕地红线不宜轻易突破。
那么，能否将新增农业用地用于耕作，转换空间来进行治理？这样既不会减少耕地面积，又可给现有农业用地以喘息之机。对此，相关人士表示，这种措施很难推行，因为在经济增长指标的压力下，相比发展农业，各个地方政府更热衷于发展二产、三产，“在城市化进程中，质量好的土地都用来造楼了，新增土地大都质量较差。现在有些围垦用地，是用河流淡水洗去土壤中的盐分、然后在上面种农作物形成的，第一年收成很少，5年以后产量才达标。”市政协常委、市农委畜牧兽医办公室主任李建颖指出，本市应在农业用地保护上多下功夫。
