细数保健食品行业的发展历程，一路走来风雨不断，从保健食品在市场初露矛头，到如雨后春笋般铺满大江南北，再到如今的保健食品商家众多，竞争激烈程度上升到白热化阶段，这一切都离不开两个字“发展”。而“发展”又靠的是什么呢?也决计离不了“革新”二字。从当年中国成为WTO会员国后，为了在国际经济大舞台上站稳脚跟，一代人付出了异常艰辛的努力。保健食品行业亦如此。从保健食品行业开始发展，到相关部门紧锣密鼓地进行制度建设，力求最佳规范市场，最终出台规范保健食品市场管理的备案制度，少不得无数人辛勤。在保健食品的发展历程中，审批制当然功不可没，然而在新的发展阶段，不可避免地出现了一些必须正视的弊端。诸如，审批制弱化了生产经营者是“第一责任人”的法律责任和法律义务，加大了政府的责任风险，造成了“重前置审批，轻后市监管”的不良风习等，对保健食品行业的整体发展来说，阻碍也空前地凸现出来。审批制备受争议，备案制出台的紧迫性由此可见。
这样的时代背景下，转换政府职能、清晰政府管理边界，进一步发挥市场配置资源的作用，是深化改革的重要内容和方向。对审批制度进行改革，逐渐过渡，并在不太长的时间内建立起完全意义上的备案制，也就成为了政府规避风险的有效措施。
而在中国保健食品行业整体发展的背景下，党中央、国务院深化政府职能改革的精神和要求，为保健食品行政许可制度改革提供了保障。同时，多年的监管实践奠定了深化改革的基础。专家建议，在进一步深化行政许可制度的改革中，应确立“科技支撑、控制风险、分类管理、择机实施”的原则，探索建立保健食品的备案管理制度和方法，通过这一制度的建立和实施，进一步落实并强化企业“第一责任人”的法律责任和法律义务。并且科学调整政府监管资源的配置，强化事中和事后的监管，完善日常监管和长效监管的机制，及时发现问题，并严厉惩治违法违规行为，及时有效控制各环节的风险，维护公平竞争，保障消费者食用安全。
