黄金大米实验，问题的核心是违规
根据目前公布出来的信息，这个事件涉及的违规不止一处，有的还相当严重。
比如说，临床实验最基本的伦理要求之一，是保证参加者或者其监护人在“充分知情”的基础上“完全志愿”。而目前的调查，不仅孩子和家长都完全不知道实验中有黄金大米，甚至连部分作者都声称不知情。除非真的如中方作者所说“没有使用黄金米饭”，这种实验材料都没有告诉志愿者的做法已经严重违反了伦理规范。如果真的没有使用，那么发表的论文就是完全捏造实验，可以算是“惊天学术丑闻”了。
此外，如果确实使用了黄金大米，那么它如何通过海关进入中国是另一个重要的问题。迄今没有一个中国机构声明提供了入关需要的手续文件，操作者就面临着“非法携带生物样品入关”的指控。
另外一个令人惊诧的问题是：三位中方作者中有两人否认此前看到过该论文，也不知道有该项研究。而在论文中，详细说明了这两位作者在研究中承担的任务。是二人在说谎？还是论文的通讯作者在造假？二者必居其一。无论哪种，都是严重的学术不端。
目前多方都在调查，真相扑朔迷离。不管调查结果如何，都应该强调：黄金大米的安全性与儿童临床实验的合理性，并不能为当事人的违规开脱，违规需要受到的罪责，完全不会因为实验本身无害而洗脱；同样，违规需要受到追究和处罚，但并不能改变“黄金大米安全有效”的事实，吃了黄金米饭的孩子，也不会因为实验流程上的违规而受到身体上的伤害。
转基因食品真的都安全？
1998年8月，英国教授普兹泰发现，老鼠食用了转基因土豆之后免疫系统遭到破坏;美国也有一些害虫的天敌因转基因植物致死的报导;2005年5月22日，英国《独立报》又披露了知名生物技术公司“孟山都”的一份报告，以转基因食品喂养的老鼠出现器官变异和血液成份改变的现象。这些消息在带给全世界震惊的同时，也使更多的人怀疑食用转基因原料制成食品的安全性。
转基因稻米会带来诸多生态环境和食品安全方面的风险。在食品安全方面，由于稻米在大多数情况下是直接食用的主粮，因此其安全性尤为关键。然而该非法转基因稻米的安全性被未经过长期评估，食用它是否安全仍存在很大疑问。在生态环境方面，由于转基因稻米在种植过程中可能发生转基因逃逸，通过花粉和种子，转基因会转移到相邻的同类型非转基因品种中。在中稻区试时，参加实验的65种水稻密密麻麻地种在一起，相互之间间隔只有大约30厘米，极容易发生转基因逃逸，造成大范围内的基因污染。
已经发现一种基因工程大豆会引起严重的过敏反应;用基因工程细菌生产的食品添加剂色氨酸曾导致37人死亡和1500多人残废。最近发现，在美国许多超级市场中的牛奶中含有在牧场中施用过的基因工程的牛生长激素。一著名的基因工程公司生产的西红柿耐储藏、便于运输，但它们含有对抗抗生素的抗药基因，这些基因可以存留在人体内。人造的特性和不可避免的不完美会一代一代的流传下去，影响其它有关及无关的生物，它们将永远无法被收回或控制， 后果是目前无法估计的。
转基因食品对动物身体器官的损害，已经被英国知名生物技术公司的一份秘密研究报告证实。转基因食品的安全性普遍存在以下几方面的怀疑：1、产生毒素或增加食品毒素含量。一些研究学者认为，转基因食品可能增加微量毒素的含量，严重的会导致某些遗传类疾病。2、营养成分减少。英国伦理和毒性中心的试验报告说，转基因食品中对人体有益的成份减少了12%至14%。3、引起人体过敏反应，造成不可预知的后果。而天然食品却不存在以上的缺点，对人体是相对安全的。
