随后，2011年12月9日，中储粮河南分公司总经理李长轩因贪腐被中纪委“双规”， 涉及金额逾10亿元。中储粮下属分公司和直属库系列漏洞的产生，一方面缘于其粮食政策性收
购职能背后的监管缺失，另一方面由于内部权力缺少制衡，决策权和执行权集于一身。
或许正是这系列案件，促使国家对中储粮管理体制进行变革，引入分权和制衡。中储粮正在设立的董事会制度，董事长和总经理同为省部级官员。
不过，确定设立董事会制度后，国家对中储粮下一步改革尚未明晰。作为国家政策性粮油企业，如何处理“政策性”和“经营性”业务的关系，这是外界最关心的。此前中储粮一度被外界质疑利用政策性优势为企业经营性业务服务，脱离了公益性的定位。
当问及国家对于中储粮政策性业务和经营性业务如何重新定位，程秉洲表示，“我们所知道的是(国家)对国有企业加强现代企业制度建设”，其表示，未提及其他方面的改革。
一粮食行业资深专家表示，“中储粮政策性业务和经营性业务说不清楚”，“要是中储粮是一个纯事业单位就好了”。在对中储粮进行管理体制改革的同时，对于国家粮食收储，政府又在收权，赋予中储粮唯一国家粮食收储的主体资格。
今年3月，国家粮食局负责人表示，2012年的粮食政策收购，中储粮将是唯一的委托收购主体，其他企业不再接受委托。
