中国食品工业近三十年获高速发展，2011年上半年总产值为3.5万亿元人民币，增速超过30%。而在这一巨大成就的背后，中国食品工业面临五大挑战：1、食品安全引发的对工业食品的“信任危机”在加重蔓延；2、粮食安全拉动的原物料价格全面上涨；3、营养安全牵动的食物结构及产业结构调整尚不到位；4、创新不足带来的同质化竞争加剧，部分行业价值下跌；5、以中国食品工业的“二元结构”为背景，科技与企业对接不畅，科技对食品产业尤其是对中小企业的创新与发展贡献率不明显。
在这五大挑战中，最关键的是食品安全与食品营养，最缺失的是站在国家利益层面的对“顶层设计”的探究。《国家食品工业十二五发展规划》中，所体现出的加速产业转型与价值提升的目标，即准确对应了上述挑战。
国民营养与健康状况是反映一个国家或地区经济与社会发展、卫生保健水平和人口素质的重要指标，更是检验食品工业发展质量及行业价值的核心元素。最近十年我国城乡居民的膳食、营养状况有了明显改善，营养不良和营养缺乏患病率继续下降，同时我国仍面临着农村营养缺乏与城市营养过度的双重挑战。而在美国农业部2010年提出的五大挑战中，儿童肥胖问题位列第三。因此，营养与健康问题是全球面临的共同挑战。
