据美国媒体6月10日表示，德国疾病防控中心负责人当天表示，调查人员已经能够认定，德国本地土产的豆芽菜正是致命大肠杆菌疫情的罪魁祸首。目前这场疫情已在全欧范围造成29人死亡，近3000人感染入院。
德国罗伯特 科赫研究所主席赖因哈德 布格尔10日告诉记者，虽然有关“毒豆芽”的最终检测结果还没有反馈回来，但是从流行病学的角度分析此次疫情爆发的模式，他们基本上可以肯定“毒豆芽”就是元凶。目前，该研究所已经解除了对黄瓜和西红柿的“禁食令”。
肠出血性大肠杆菌被发现时，罗伯特 科赫学院的最初实验室检验结果发现患者大部分食用过黄瓜和西红柿，于是政府有关机构对这几种蔬菜发出食用警告，首先对西班牙进口黄瓜造成严重损失，德国国产蔬菜跟着遭殃，继之整个欧盟也遭到不同程度的影响。
据悉，致病豆芽产自德国下萨克森州一家芽类蔬菜厂，该厂曾为多家企业食堂及餐厅提供豆芽作为沙拉原料。目前这家蔬菜厂已被关闭并禁止出售除豆芽外的其它蔬菜产品。
5月底，德国出现大肠杆菌感染事件后，德国汉堡医学实验室进行细菌培养的化验结果初步证实，病菌可能来自西班牙生产的黄瓜。但到了5月31日，德国汉堡卫生当局宣布，实验室的最新化验结果显示，德国出现的大肠杆菌感染病源并不是西班牙的黄瓜。
6月5日，德国下萨克森州农业部有关官员宣称，该州农场生产的豆芽被初步认定为近来德国大肠杆菌的病源，当局随后关闭了相关豆芽生产厂。6月6日，德国下萨克森州农业部又收回了5日的说法，否认该州农场生产的豆芽是大肠杆菌的病源。直到今日，德国又再次改口称，德国本地产的豆芽确实是疫情的元凶。
