安全蔬菜是以高额成本为代价的。不用农药、不施化肥的有机蔬菜成了市场里的“贵族”，价格一点都不“亲民”。
有机黄瓜在上海鸥阁农业有限公司的进货价是11.4元/公斤，售出价是17.5元/公斤，即便以较低的进货价每公斤11.4元作为比较基准，这个价格也是市面上普通黄瓜价格的两倍以上。
有机蔬菜如此高价，业内人士认为有多方面的原因：从生长周期来看，常规使用农药化肥的黄瓜开花后到成熟可采摘，只要6天，而有机黄瓜要9天；整个黄瓜生长期，一般要30天左右，有机黄瓜要40天；在产量上，一个大棚里的常规黄瓜的产量可达1万斤左右，而有机黄瓜的产量大约只有5000斤。
有机蔬菜由于不能使用农药、化肥，菜田的日常管理和虫害防治需要更多人手。东周丰源(北京)有机农业有限公司销售总监助理薛东东说，常规黄瓜除草只要使用除草剂就可以了，但是有机黄瓜需要人工除草，现在请一个工人一天要60~70元。
而有机西红柿等需要自然界的蜜蜂授粉，常规的品种使用激素就可以达到授粉的效果。况且，蜜蜂授粉情况还不一定都好，导致产量只有常规品种的60%~70%。山东一家有机西红柿的生产销售企业人士表示，通过蜜蜂来给西红柿授粉，一窝蜜蜂的价格要1000元左右，产量只有常规西红柿的约一半。
投入的“血本”还远不止这些。决定有机蔬菜成本高企的另一个因素是要达到适合有机蔬菜生长的要求，必须改造土壤和水环境。薛东东告诉记者，国内土地由于长期使用化肥，一些地区土壤出现板结，对化肥的吸收率降至30%左右，要达到同样的供肥效果，现在只能施用更多的化肥，土壤的质量在不断下降，同时大量化肥流失到河流湖泊等水体中形成污染，而有机蔬菜的种植需要没有化肥成分的土壤和水，将土壤和水还原回原先的自然状态，成本较高。
多利农庄在上海有1750亩的有机蔬菜种植基地，土壤和水的有机化改造花费了约3年的时间，多利农庄总经理郭海称，在土地有机化改造方面，少的每亩要1万~2万元，有些土地的改造成本更高。在水环境的改造方面，为了达到有机蔬菜的生产标准，多利农庄已投入了6000万元。
因成本高企，有机蔬菜的种植和消费都难以普及。有关人士反映，目前全国不使用农药、化肥的有机蔬菜占市场份额仅为0.3%左右，虽然中国人口众多，但菜地面积有限，保证全国蔬菜供应压力较大，有机蔬菜大量推广的可能性不大，目前主要是高端消费者有能力接受有机蔬菜。
中国是蔬菜生产第一大国，也是世界农药产量第一大国，农药残留一直是一个令人头疼的问题。一位蔬菜生产企业的人士坦率地告诉记者，像黄瓜等蔬菜品种，几乎就是泡在农药里长大的。
2009年，我国蔬菜播种面积和产量分别占世界的43%和49%，均居世界第一。据农业部农情统计，2009年全国的蔬菜播种面积0.18亿公顷，总产量6.02亿吨。而据国家统计局的数据，2008年中国农药产量为190.2万吨，占全球农药总产量近一半，年均使用量50万吨以上，其中，使用在蔬菜作物方面的化学农药占了绝大部分。
有关机构曾于2008年和2009年对北京、上海和广州常见蔬菜水果进行抽检，结果显示，大多数蔬菜水果都有农药残留，更为严重的是，45份样品中检测出50种农药成分，30个样品残留着至少5种以上不同的农药。
