3.无公害食品生产与销售脱节。
由于无公害食品科技含量高、生产成本大，加之人民群众对其认同度的不高，致使无公害食品销售渠道不畅，价格也没有明显的优势，优质得不到优价，多数生产者及经营者没有见到明显的实惠。
4.假劣食品流向城乡结合部及农村牧区。
随着城市流通领域食品安全监管力度的不断加大，假冒伪劣食品难有藏身之地，一些不法商贩便利用农村牧区市场信息闭塞、农牧民消费水平低、缺乏自我保护意识等问题，将城区市场已经过期或者将要过期的食品通过“商品展销会”、“送货下乡”等形式，低价倾销到农村牧区市场，致使农村牧区市场成为假冒伪劣食品的集散地;非法食品加工厂家也由城市转向农村，利用当地的廉价劳动力，继续违法生产销售假冒伪劣食品，坑害农村牧区消费者。
这些生产加工点普遍存在着“小、乱、散”的现象，大多以租赁房屋和家庭作坊式的个体加工业为主，经营者食品质量意识不强，基本没有检测设备及手段，房屋设施简陋，从业人员素质低，生产条件差，产品质量难以保证。
5.监管职能分散，协调难的问题依然存在。
从“农田到餐桌”的安全食物链分属工商、卫生、质监、农牧等多个部门监管，由于这些部门管理体制不同，人、财、物的主管部门各有其主，有的在该唱主角时却当了配角，有的在该当配角时却唱了主角。
6.政府对“食品安全”经费投入不足，监管工作到位难。
近年来，我国在流通领域食品安全监管方面投入经费少，一些检测设备老化，未能及时更新，另外还缺少一些必备的检测设备;抽检经费严重不足，难以及时检验食品质量的真伪，检查中经常出现一些无法认定的质量问题，大大制约了食品安全监管工作的开展。以工商部门为例，如果想检测，只有委托外地相关部门。对于涉嫌不合格的食品，因不能及时进行检验，如果要扣留又没有法定的依据，使监管执法陷于被动状态。
7.食品安全监管执法难度较大。
某些经营者在不办理任何证照的情况下，就理直气壮地开业，而且又不懂法律和政策，因此在执法时常常遭到他们的阻挠和抵触，有时还出现“暴力抗法”;有些经营户流动性大，加之所售食品来源不明，进货渠道乱，索证索票难，而且极易反弹，执法难度较大，给食品安全带来了严重隐患，特别是私屠乱宰等问题在一些地区还比较突出。
三、解决食品安全问题的对策
1.加强宣传教育，提高全民素质
一是对全民进行食品安全知识的宣传教育，利用一切媒体宣传食品安全科普知识、科学种植养殖知识等;二是加强对环境保护的宣传，强化人们的环保意识，使国民珍爱我们的环境，使每一个人在办每一件事时，都要从保护我们的环境出发。三是加强社会主义道德、诚信、公德的宣传教育，加强社会信用、企业信用和个人信用的建设，形成诚实、诚信的社会氛围，只有全民素质提高了，食品安全问题才能从根本上得到解决。
