以前，国内企业很少使用臭氧进行杀菌，近年来，矿泉水企业普遍采用臭氧杀菌工艺，致使溴酸盐现象凸显。国家质检总局近期开展的瓶装饮用水溴酸盐国家监督专项抽查，抽检104种瓶装水，有13种产品溴酸盐含量超过《生活饮用水卫生标准》的限量要求。在国际上，世界卫生组织（WHO）和美国环保局（EPA）所规定的饮用水中，溴酸盐最高允许浓度在0.01mg/L以内，新国标中该项指标与世界卫生组织标准一致。
增加3项微生物指标
新国标中微生物指标增加了粪链球菌、铜绿假单胞菌和产气荚膜梭菌3项，删去菌落总数1项，其目的一是和国际标准接轨，二是控制矿泉水生产过程中溴酸盐的产生。
据了解，粪链球菌是水体遭受粪便污染的一个“指针”，由于人的粪便中粪大肠菌群数明显多于粪链球菌数，而家禽及其它温血动物的粪便则相反，因此，测定水体中粪大肠菌群与粪链球菌的比值，有助于了解污染的主要来源。
铜绿假单胞菌在自然界分布广泛，是土壤中存在的最常见的细菌之一。它能产生内毒素、多种致病因子，可以引发肺萎缩和坏死、肝细胞肿胀、脂肪变性和坏死等。而产气荚膜杆菌具有芽孢，污染水体后存活时间较长，对氯等消毒剂有较强的抵抗力，是气性坏疽的主要病原菌。
在饮用天然矿泉水上，世界卫生组织一直对这几种致病菌控制严格。对致病菌的严格控制，也是国际上普遍认可的保障饮用水安全的措施。此外，根据新标准，矿泉水中锶的含量由原来规定的必须达到0.2mg/L以上，调整为0.4mg/L以上。因为锶含量的增加对心脏病和癌症的治疗有病理上的辅助功效。
删除了菌落总数
国内饮用水标准中，一直都将微生物指标菌落总数作为最重要的强制性指标，而世界卫生组织（WHO）、美国环保局（EPA）等最新标准中都对致病菌的控制越来越严格，但细菌总数不再出现在标准之中。新国标微生物指标的增删是与国际标准接轨的体现，删去菌落总数不是降低标准，实际上是更严格，要求企业生产过程控制要达到更高水平。
矿泉水国标过去一直对菌落总数限定严格，每亳升不得超过50个，菌落总数不合格是导致饮用水抽检不合格的最主要原因。正因为菌落总数限定严格，致使不少矿泉水生产企业为之头痛，在生产中为了控制菌落总数而加大臭氧投放量，也增大了溴酸盐产生的机率。新国标菌落总数删除后，因臭氧杀菌产生溴酸盐的问题将在一定程度上得到解决。
