历史证明，大灾之后极易继发大疫。为严防灾后人畜共患病及重大动物疫情的发生，力避灾区人民群众次生灾情危害，农业部抗震救灾专家组与四川省畜牧食品局领导深入灾区调查动物灾情后，分析了当前灾区动物疫情的严峻形势，做出了迅速组织动物消毒无害化处理队伍的决定，立即采取先外后内的步骤，立即开展灾区灾后死亡畜禽无害化处理工作，确保“大灾之后无大疫”、“有疫不流行、有病不成灾”。
14日～15日，农业部抗震救灾专家组和省畜牧食品局抗震救灾工作组分两路到成都市的都江堰市、彭州市，德阳市的什邡市、绵竹市，绵阳市的北川县、安县等重灾区，调查灾情、慰问受灾干部职工和群众、指导抗震救灾工作。
农业部专家组和我局根据灾情和灾后疫病发生的规律，结合四川历史以来炭疽、猪链球菌病等人畜共患病易发的特点，分析了抗灾形势，认为灾区大量牲畜死亡后，在大雨和高温天气交错作用的情况下，48小时后尸体很快腐败变质，污染土壤和水源，极易引发炭疽、猪链球菌病、乙型脑炎等人畜共患疾病和重大动物疫情。为最大限度地降低灾害损失，防止发生次生灾害，农业部专家组要求，一是随着抢救受灾人员工作的推进，在不影响救人这一首要任务的前提下，各级畜牧兽医部门要把消毒和病害死亡畜禽的无害化处理工作作为重要而紧迫的任务，迅速组织力量，按照由外到内逐步推进的原则，开展消毒和无害化处理工作。二是加强检疫监管工作，防止病害畜产品进入市场，确保畜产品质量安全。三是针对灾区畜牧兽医部门人员伤亡、房屋倒塌，难以有效开展工作的问题，要求我局紧急动员组织局机关、直属事业单位和大专院校畜牧兽医专业老师、学生志愿者，组建三个动物防疫应急分队，携带消毒药品和相关器械，迅速赶往成都、德阳、绵阳三个重灾市的重点区域，在当地畜牧兽医部门的配合下，开展以规模养殖场（小区）为重点的消毒和无害化处理工作。
按农业部专家组要求，5月16日上午10时，局党组书记、局长杨昌明主持召开紧急动员会。会上贾幼陵对有关工作进行了统一部署，提出了明确要求。我局从局机关、直属事业单位抽调精干力量和专业技术人员，会同80名来自四川农业大学、西南民族大学畜牧兽医专业的志愿者，成立了100多人组成的三个应急分队和一个后勤保障组，由我局统一配备帐篷、睡袋、药品器械等物资，在但其明副局长、兰明建副局长的组织带领下，17日上午将奔赴灾区开展工作
