2006年12月中旬，国家发改委宣布暂停核准玉米深加工项目，一份旨在规范燃料乙醇项目的“产业政策50条”也正在拟定中。2006年12月25日《经济观察报》对此作了报道。2006年9月27日，温家宝总理做出批示，指出“对玉米深加工的科学规划和宏观调控，不仅关系玉米深加工业的健康发展，而且关系国家粮食安全，必须高度重视”。2006年12月中旬，国家发改委的一份紧急通知发往各地。根据这份通知，玉米深加工项目备案及核准被叫停。发改委将对在建和拟建项目进行全面清理。并且，在国务院批准实施《生物燃料乙醇及车用乙醇汽油“十一五”发展专项规划》前，任何地区无论是以非粮原料还是其他原料的燃料乙醇项目核准和建设一律要报国家审定。目前，国家有关部门已经完成《“十一五”专项规划》的制定工作。另外，发改委已拟定了与此相关的“产业政策五十条”。这份文件对投资企业资产、生产能力、生产经验以及环保能耗、原料保障等做出了严格限制。
