在NSFC-广东联合基金重点项目的资助下，中山大学海洋学院教授何建国项目组完成3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列的测定和分析。在此基础上，他们提出了虹彩病毒的一个新属，并找到该病毒里3个与鱼类免疫信号传导系统相互作用的基因。
在鳜鱼、石斑鱼、大黄鱼等多种海淡水养殖鱼类中频繁流行，对鳜鱼(俗称桂花鱼)的致死率接近100%，对石斑鱼、美国红鱼等种类的致死率也极高，致使感染鱼类出现大面积死亡……这种可怕的病毒就是虹彩病毒，由它引起的疾病已成为危害我国养殖鱼类最严重的病毒病之一。
但是，目前尚无适当的疫苗或药物可以有效防治该疾病。
事实上，这也是我国水产养殖业整体情况的一个缩影。随着可捕捞资源的急剧减少，水产养殖已成为我国为满足人民群众日益增长的蛋白质需求而普遍实施的主要举措。但病害严重制约了我国水产养殖业的健康可持续发展。
“我国的水产养殖量占全世界70%，而相对应的是：近年来，病害导致的我国水产养殖业直接经济损失每年超过百亿元。而防治病害带来的药物滥用导致水产品药物残留等食品安全问题，又造成了病原微生物耐药性增加及养殖环境恶化；还会给我国水产品的出口自我设障。因此，开展病害发生和免疫防治研究非常重要。”何建国说道。
从基础开始的研究
何建国说：“就我个人观点而言，应用研究和基础研究很难被人为割裂，在技术发展的很多阶段，都是科学问题在基础研究中取得突破，才最终解决了技术问题。我们此次申请的NSFC-广东联合基金重点项目课题主要就是针对虹彩病毒病开展应用基础研究，并为应用研究奠定基础。”
何建国继续说道：“我们重点要解决的问题是虹彩病毒致病的分子基础，研究哪个功能基因导致发病，搞清楚病毒的致病基因与宿主的免疫系统之间的相互作用是怎样的。这样才能从源头上解决问题。”
何建国项目组的研究重点刚好契合了当前研究的热点——病原致病性相关的功能基因。
而整个科研大环境也为何建国的研究提供了坚实基础。基因大规模测序技术的成熟，大大促进了病原微生物基因组学数据库的丰富，基因组学揭示了生物体结构的遗传分子特征；而蛋白质组学研究则为揭示动态的生命过程提供了全新的认识。
蛋白质组学概念的提出使人们对疾病的了解深入到了系统的分子作用水平，为疾病的早期诊断、新药研发等提供了重要的高灵敏和高通量的技术途径。
