一、适时分期采收莲藕采收过早会影响产量，采收过晚品质下降，因此，应根据需要确定适宜的采收期。
1．花香藕即刚长成型的藕，也叫嫩藕。这种藕的淀粉含量较低，具有鲜嫩甜脆的特点。在脚层叶黄绿色，中层叶深绿色，上层叶均已定型，整体中没有新叶出现时采收，以9月上旬为好。但此时采收会影响产量，只宜少采收。
2．中秋藕在中秋节前后采收，主要供应中秋节和国庆节市场。此时的脚层叶全部枯萎，中层叶色发黄，上层叶色呈黄绿色。
3．红锈藕和白锈藕红锈藕一般在10月中旬采收，因这时藕表面有铁锈色而得名。红锈藕内的淀粉含量较多，可作熟食用或加工成藕粉。到了10月底藕身转白，称为白锈藕，此时的藕淀粉含量丰富，除作加工和熟食用外，多余部分可贮存到翌年开春以后。如要留小藕作种，必须在10月底以后采收。
二、采收的方法在采收前两周放干田水。采收时先寻找终止叶，此叶生长在藕节中段，叶片平展角度小，大多处于半展开状态，叶柄细长，叶片向前倾，叶柄的弹性较好。找到终止叶后，可根据终止叶与后栋叶之间的距离来估量藕的深浅。如终止叶与后栋叶之间的距离长，则藕头入泥深，反之则浅。
采收莲藕时，用脚沿着叶柄向下踏至泥土里，先采收上层的藕，然后再采收下层的藕。采藕的操作方法是将藕身下面的泥土扒开，用右手抓住藕的后把，左手托住藕身中段，慢慢地把藕拖出来。采收时应注意保护好藕的后把，以防止藕节断裂，使泥浆灌入孔隙。下年还要继续种藕的田块，应将田坎四周2米内的藕采完。田中间每隔2米留30厘米不采收，或将藕的前两段采收完，留最后一节子藕作翌年的种藕。采收的莲藕不忙洗泥，待出售前再洗，这样可减少变色，提高莲藕的新鲜品质。
三、莲藕的贮存与运输莲藕较耐贮存，冬季在室内可贮存5周以上，春季也能贮存2周－3周。但需要贮存的莲藕一定要老熟，藕节完好，藕身带泥无损，藕节折断处用泥封好。莲藕在贮存和运输过程中不能堆放过厚，并应在藕面上盖一层稻草，注意常洒些水保持湿润，定期翻动，防止发热闷烂。
