西红花临床应用主要有两点：
第一，用于血瘀诸证。西红花有活血祛瘀功效，常用于血瘀所致的痛经、经闭、月经不调，产后恶露不净、腰腹疼痛，腹中包块疼痛，跌扑损伤肿痛，可单味煎服，也可与其他活血药配用以增强药力。如治痛经、经闭，配益母草、丹参等同用；治产后恶露不尽，与当归、赤芍等同用。本品活血之中又有散郁开结功能，可用于各种痞结之证。
第二，用于温病热入营血引起的发斑、发疹。西红花能凉血解毒，可单用或配清热解毒之品，如大青叶、板蓝根等同用；治麻疹热盛血郁，疹透不快或疹出过密，疹色晦暗者，常与紫草、赤芍配伍同用。无论草红花还是西红花，孕妇均忌用。
功效相似的两种红花，价格为何存在不同呢？谜底就在西红花的药用部位上。西红花属鸢尾科多年生宿根草本植物，没有地上茎，其根似球状，药用部位是其花柱的上部及柱头。因其产量很低，显得紧缺珍贵。据统计，约2000多朵花只能产1克西红花。一亩地产量只有1.5千克～2千克。
