1、土壤盐化，酸化程度高，由于连续多年搞辣椒等茄果类蔬菜生产，化肥施用量逐年增加，如山东寿光仅底肥投入就300多公斤左右，其化肥的利用率仅30%左右，大量的酸性化肥都残留在土壤中，化肥本身也是一种盐，势必造成土壤酸化、盐化程度提高，有些老大棚的PH值竟达到了3-5。而辣椒等蔬菜正常生长的PH值应在5.5-7之间，可以想象辣椒在这样酸的环境下怎样正常生长，能不出现死秧的现象吗？
2、土壤中的生物菌群比例失调，也就是说由于多年的生产会造成土壤中有益的微生物如光合菌、解磷菌、有益的虫子如蚯蚓越来越少，而有害的微生物如镰刀菌,有害的虫子如地老虎、蛴螬越多。这样势必会引起一些重茬病害、虫害的加重发生。
3、土壤中养分比例的严重失衡，由于辣椒等蔬菜的产量特别高，最高亩产可达几万斤以上，产量高作物吸收和需求的养分就多，随着辣椒的采收土壤中的大量养分被带走。为了保证作物持续的高产稳产，带走的养分，我们通过施肥得了及时的补充，但我们只注重化肥的施用，而化肥的养分比较单一，这样，就会出现土壤中的个别养分缺乏，造成土壤养分失调，根据作物的最小养份定律，土壤中只有缺什么养分，补充什么养分，才能会让作物获得稳定的产量。施肥的不到位，年年重茬土壤中个别养分的缺乏，会造成产量下降，作物的抵抗能力下降，导致病害大面积的发生。
4、土壤中的氮碳比失调。碳是土壤生命之源，无碳即无生物，无生物不长植物，随着辣椒等蔬菜产量的提高，化肥用量增大，土壤中的碳素营养和有益微生物被大量消耗，而得不到补充，使土壤肥力下降，造成化学肥料越来越没劲，土壤碳氮比仅为8：1，严重制约产量，并且引发多种病害，如霜霉病、病毒病，灰霉病、根腐病等，当喷药防治这些病害无效时，应及时补充碳素营养，施用一些微生物肥料，只有碳、氮比达30：1时，这些病害才会消失，不治而愈。
