为了掌握流通环节食品市场主体情况，2004年各级工商机关统一开展了食品经营主体及其经营情况调查摸底工作。结合调查摸底，各级工商机关积极动员教育和督促指导食品经营者开展了自查自纠活动，不少市场还自购了检测设备加强质量自检。各级工商机关还进一步严格食品经营主体准入，建立健全食品市场巡查制，强化基层日常监管。据统计，共有5455户食品经营者在整顿期间被依法吊销了营业执照。
国家工商总局组织了两次大规模的食品质量监督检查，统一部署28个省、自治区、直辖市，对粮、肉、蔬菜等21种食品进行了监测。各地工商机关充分发挥当地检测机构的作用，针对本辖区内重点食品普遍开展了质量抽样监测工作。2004年部分重点食品品种的质量抽检合格率同上年相比提高了8％，流通环节食品质量有了明显改善。
在加强食品市场日常监管的同时，各级工商机关还围绕国家工商总局确定的10种重点整治的食品，针对季节性食品消费和节日食品消费的特点，在统一部署下，集中开展了3次专项整治行动，查获假冒伪劣食品价值9．2亿元，共查处制售假冒伪劣食品违法案件11万余件，捣毁制假售假窝点11087个，移送公安机关案件124件。