正常生长的黄瓜结出的瓜条顺直，先端稍尖。但如黄瓜生长发育过程中遇到营养不良，光照不足，管理不善等环境条件，特别是棚室反季节栽培过程中，常因某些条件不能满足黄瓜的生长要求而出现瓜条畸形现象，有时出现苦味瓜。黄瓜畸形属于生理性病害，常见的有细腰瓜、弯瓜、大肚瓜等，从而影响黄瓜的商品价值和产量，应当及早预防。
细腰瓜 细腰瓜是指在瓜的纵轴中央部分，一处或几处出现皱缩而变细。变细部分往往易折断，中间是空的，常变成褐色。在保护地环境下，植株受精不充分而发育成细腰瓜或营养供应不均衡或由于高温高湿的条件易使黄瓜植株长势过旺，以后植株又处在连续高温干燥的环境时，植株长势减弱，使正常生长的瓜生长受限，便会发生细腰瓜；此外，黄瓜感染黑星病或缺硼，也会产生细腰瓜。
预防措施：创造良好的授粉条件，加强营养供应，特别是坐果期肥水供应，补施硼肥，及时防治病虫害，也可在开花初期采用0.05%～0.1%的2，4-D激素喷雾，促进瓜果长直。
弯瓜 黄瓜属高水肥蔬菜，在黄瓜结瓜盛期，需要充足的温度、光照和大量的水肥，才能够满足黄瓜结果期的养分需求。如果天气昼夜温差过大，大风和弱光照，加之黄瓜管理中水肥跟不上，严重影响了黄瓜的子房发育，容易形成弯曲瓜；磷、钾肥施用较多和结瓜期遇到干旱的情况下，也易出现弯曲瓜条，而且瓜条不具健嫩光泽。
预防措施：黄瓜在育苗时，应为花芽分化创造良好的条件；在黄瓜果实膨大期应加强肥水管理，黄瓜每采摘一次，都要随水冲施氮、磷、钾复合肥一次，确保黄瓜中后期植株生长不衰弱；合理密植，清洁棚膜，增加棚内的通风透光性能；增施有机肥，保持根系土层疏松，土壤不缺水。
大肚瓜 黄瓜受精不完全，仅中间到尖端受精，则受精的部位加快肥大，未受精部位生长受阻；加之果实膨大前期营养供应不足或遇干旱就易形成大肚尖嘴瓜；单性结实的黄瓜，在瓜膨大的前期，如营养供应不良，也易出现大肚子尖嘴瓜；黄瓜盛果期放松了肥水管理，使植株生长衰弱或近期黄瓜落秧时，打下部老叶时强度过大；土壤中缺钾。
预防措施：改善黄瓜下部叶片通风透光条件，提高叶片的同化功能，打下部老叶时强度不能太大；对于单性结实差的品种，要防止受精不全，在结果盛期到后期，应加强肥水管理，黄瓜每采摘一次，都要随水冲施氮、磷、钾复合肥一次，防止土壤过干；叶面喷施0.3%～0.5%的磷酸二氢钾。
苦味瓜 由于生产中氮肥施用过量或磷、钾肥不足，特别是氮肥施用突然过量造成植株徒长，坐瓜不整齐，在侧枝、弱枝上结出的瓜易出现苦味，此外，如遇低温寡照天气特别是阴天，黄瓜的根系或活动受损，吸收的水分和养分少，瓜条生长缓慢，往往在根系和下部瓜中积累更多的苦味素而导致瓜有苦味。苦味还有遗传性，叶色深绿的苦味多。苦味多发生在近瓜柄处，先端部分很少出现。
预防措施：选用无苦味的品种如津杂、津春系列等；加强温度的管理，苗期及结瓜初期温度应控制在13℃以上，结瓜后期控制在32℃以下；勤灌水，避免水分亏损，根瓜控水要适度，不可过度控水；平衡施肥，合理供应各种矿质元素，施肥时掌握氮、磷、钾配比在5∶2∶6，避免氮肥过多或过少；生育后期采用叶面喷肥，确保植株健壮生长。此外，喷洒生物制剂健植宝可有效预防苦味瓜的发生。
